Protein–RNA interactions for Protein: O55226

Chad, Chondroadherin, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChadO55226 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ChadO55226 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ChadO55226 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ChadO55226 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ChadO55226 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChadO55226 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChadO55226 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChadO55226 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChadO55226 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChadO55226 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChadO55226 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChadO55226 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChadO55226 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChadO55226 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChadO55226 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChadO55226 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ChadO55226 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ChadO55226 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ChadO55226 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChadO55226 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChadO55226 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChadO55226 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChadO55226 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChadO55226 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChadO55226 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChadO55226 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChadO55226 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChadO55226 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ChadO55226 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChadO55226 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChadO55226 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChadO55226 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ChadO55226 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ChadO55226 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChadO55226 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ChadO55226 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChadO55226 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChadO55226 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChadO55226 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChadO55226 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChadO55226 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChadO55226 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChadO55226 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChadO55226 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ChadO55226 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChadO55226 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChadO55226 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChadO55226 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChadO55226 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ChadO55226 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChadO55226 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChadO55226 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ChadO55226 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ChadO55226 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ChadO55226 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ChadO55226 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChadO55226 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChadO55226 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChadO55226 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChadO55226 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChadO55226 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChadO55226 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChadO55226 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChadO55226 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChadO55226 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChadO55226 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChadO55226 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChadO55226 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChadO55226 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChadO55226 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChadO55226 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChadO55226 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChadO55226 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChadO55226 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChadO55226 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChadO55226 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ChadO55226 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChadO55226 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChadO55226 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChadO55226 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChadO55226 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChadO55226 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChadO55226 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ChadO55226 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ChadO55226 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ChadO55226 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ChadO55226 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ChadO55226 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ChadO55226 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ChadO55226 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ChadO55226 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChadO55226 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChadO55226 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChadO55226 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChadO55226 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChadO55226 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChadO55226 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ChadO55226 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChadO55226 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChadO55226 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms