Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Atp10aO54827 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Atp10aO54827 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Atp10aO54827 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Atp10aO54827 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Atp10aO54827 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Atp10aO54827 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Atp10aO54827 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Atp10aO54827 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Atp10aO54827 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Atp10aO54827 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Atp10aO54827 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Atp10aO54827 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Atp10aO54827 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Atp10aO54827 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Atp10aO54827 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Atp10aO54827 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Atp10aO54827 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Atp10aO54827 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Atp10aO54827 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Atp10aO54827 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Atp10aO54827 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Atp10aO54827 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Atp10aO54827 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Atp10aO54827 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Atp10aO54827 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Atp10aO54827 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Atp10aO54827 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Atp10aO54827 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Atp10aO54827 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Atp10aO54827 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Atp10aO54827 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Atp10aO54827 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Atp10aO54827 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Atp10aO54827 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Atp10aO54827 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Atp10aO54827 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Atp10aO54827 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Atp10aO54827 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Atp10aO54827 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Atp10aO54827 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Atp10aO54827 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Atp10aO54827 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Atp10aO54827 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Atp10aO54827 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Atp10aO54827 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Atp10aO54827 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Atp10aO54827 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Atp10aO54827 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Atp10aO54827 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Atp10aO54827 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Atp10aO54827 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Atp10aO54827 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Atp10aO54827 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Atp10aO54827 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Atp10aO54827 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Atp10aO54827 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Atp10aO54827 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Atp10aO54827 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Atp10aO54827 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Atp10aO54827 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Atp10aO54827 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Atp10aO54827 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Atp10aO54827 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Atp10aO54827 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Atp10aO54827 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Atp10aO54827 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Atp10aO54827 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Atp10aO54827 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Atp10aO54827 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Atp10aO54827 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Atp10aO54827 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Atp10aO54827 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Atp10aO54827 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Atp10aO54827 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Atp10aO54827 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Atp10aO54827 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Atp10aO54827 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Atp10aO54827 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Atp10aO54827 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Atp10aO54827 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Atp10aO54827 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Atp10aO54827 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Atp10aO54827 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Atp10aO54827 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Atp10aO54827 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Atp10aO54827 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Atp10aO54827 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Atp10aO54827 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Atp10aO54827 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Atp10aO54827 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Atp10aO54827 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Atp10aO54827 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Atp10aO54827 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Atp10aO54827 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Atp10aO54827 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Atp10aO54827 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Atp10aO54827 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Atp10aO54827 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Atp10aO54827 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms