Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CrxO54751 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CrxO54751 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CrxO54751 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CrxO54751 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CrxO54751 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CrxO54751 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CrxO54751 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CrxO54751 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CrxO54751 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CrxO54751 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CrxO54751 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CrxO54751 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CrxO54751 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CrxO54751 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CrxO54751 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CrxO54751 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CrxO54751 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CrxO54751 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CrxO54751 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CrxO54751 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CrxO54751 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CrxO54751 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CrxO54751 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CrxO54751 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CrxO54751 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CrxO54751 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CrxO54751 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CrxO54751 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CrxO54751 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CrxO54751 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CrxO54751 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CrxO54751 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CrxO54751 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CrxO54751 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CrxO54751 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CrxO54751 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CrxO54751 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CrxO54751 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CrxO54751 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CrxO54751 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CrxO54751 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CrxO54751 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CrxO54751 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CrxO54751 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CrxO54751 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CrxO54751 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CrxO54751 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CrxO54751 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CrxO54751 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CrxO54751 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CrxO54751 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CrxO54751 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CrxO54751 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CrxO54751 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CrxO54751 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CrxO54751 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CrxO54751 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CrxO54751 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CrxO54751 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CrxO54751 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CrxO54751 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CrxO54751 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CrxO54751 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CrxO54751 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CrxO54751 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CrxO54751 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CrxO54751 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CrxO54751 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CrxO54751 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CrxO54751 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CrxO54751 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CrxO54751 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CrxO54751 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CrxO54751 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CrxO54751 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CrxO54751 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CrxO54751 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CrxO54751 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CrxO54751 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CrxO54751 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CrxO54751 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CrxO54751 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CrxO54751 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CrxO54751 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CrxO54751 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CrxO54751 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CrxO54751 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CrxO54751 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CrxO54751 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CrxO54751 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CrxO54751 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CrxO54751 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CrxO54751 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CrxO54751 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CrxO54751 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CrxO54751 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CrxO54751 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CrxO54751 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CrxO54751 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms