Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cavin1O54724 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cavin1O54724 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cavin1O54724 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cavin1O54724 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cavin1O54724 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cavin1O54724 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cavin1O54724 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cavin1O54724 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cavin1O54724 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cavin1O54724 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cavin1O54724 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cavin1O54724 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cavin1O54724 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cavin1O54724 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cavin1O54724 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cavin1O54724 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cavin1O54724 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cavin1O54724 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cavin1O54724 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cavin1O54724 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cavin1O54724 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cavin1O54724 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cavin1O54724 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cavin1O54724 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cavin1O54724 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cavin1O54724 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cavin1O54724 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cavin1O54724 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cavin1O54724 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cavin1O54724 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cavin1O54724 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cavin1O54724 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cavin1O54724 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cavin1O54724 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cavin1O54724 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cavin1O54724 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cavin1O54724 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cavin1O54724 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cavin1O54724 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cavin1O54724 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cavin1O54724 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cavin1O54724 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cavin1O54724 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cavin1O54724 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cavin1O54724 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cavin1O54724 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cavin1O54724 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cavin1O54724 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cavin1O54724 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cavin1O54724 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cavin1O54724 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cavin1O54724 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cavin1O54724 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cavin1O54724 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cavin1O54724 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cavin1O54724 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cavin1O54724 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cavin1O54724 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cavin1O54724 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cavin1O54724 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cavin1O54724 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cavin1O54724 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cavin1O54724 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cavin1O54724 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cavin1O54724 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cavin1O54724 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cavin1O54724 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cavin1O54724 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cavin1O54724 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cavin1O54724 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cavin1O54724 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cavin1O54724 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cavin1O54724 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cavin1O54724 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cavin1O54724 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cavin1O54724 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cavin1O54724 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cavin1O54724 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cavin1O54724 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cavin1O54724 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cavin1O54724 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cavin1O54724 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cavin1O54724 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cavin1O54724 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cavin1O54724 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cavin1O54724 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cavin1O54724 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cavin1O54724 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cavin1O54724 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cavin1O54724 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cavin1O54724 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cavin1O54724 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cavin1O54724 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cavin1O54724 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cavin1O54724 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cavin1O54724 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cavin1O54724 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cavin1O54724 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cavin1O54724 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.4 ms