Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Edil3O35474 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Edil3O35474 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Edil3O35474 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Edil3O35474 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Edil3O35474 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Edil3O35474 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Edil3O35474 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Edil3O35474 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Edil3O35474 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Edil3O35474 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Edil3O35474 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Edil3O35474 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Edil3O35474 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Edil3O35474 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Edil3O35474 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Edil3O35474 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Edil3O35474 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Edil3O35474 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Edil3O35474 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Edil3O35474 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Edil3O35474 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Edil3O35474 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Edil3O35474 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Edil3O35474 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Edil3O35474 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Edil3O35474 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Edil3O35474 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Edil3O35474 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Edil3O35474 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Edil3O35474 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Edil3O35474 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Edil3O35474 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Edil3O35474 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Edil3O35474 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Edil3O35474 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Edil3O35474 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Edil3O35474 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Edil3O35474 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Edil3O35474 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Edil3O35474 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Edil3O35474 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Edil3O35474 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Edil3O35474 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Edil3O35474 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Edil3O35474 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Edil3O35474 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Edil3O35474 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Edil3O35474 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Edil3O35474 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Edil3O35474 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Edil3O35474 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Edil3O35474 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Edil3O35474 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Edil3O35474 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Edil3O35474 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Edil3O35474 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Edil3O35474 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Edil3O35474 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Edil3O35474 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Edil3O35474 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Edil3O35474 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Edil3O35474 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Edil3O35474 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Edil3O35474 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Edil3O35474 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Edil3O35474 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Edil3O35474 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Edil3O35474 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Edil3O35474 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Edil3O35474 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Edil3O35474 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Edil3O35474 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Edil3O35474 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Edil3O35474 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Edil3O35474 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Edil3O35474 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Edil3O35474 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Edil3O35474 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Edil3O35474 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Edil3O35474 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Edil3O35474 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Edil3O35474 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Edil3O35474 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Edil3O35474 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Edil3O35474 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Edil3O35474 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Edil3O35474 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Edil3O35474 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Edil3O35474 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Edil3O35474 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Edil3O35474 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Edil3O35474 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Edil3O35474 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Edil3O35474 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Edil3O35474 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Edil3O35474 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Edil3O35474 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Edil3O35474 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Edil3O35474 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms