Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srsf5O35326 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Srsf5O35326 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Srsf5O35326 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Srsf5O35326 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Srsf5O35326 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Srsf5O35326 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Srsf5O35326 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Srsf5O35326 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Srsf5O35326 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Srsf5O35326 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Srsf5O35326 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Srsf5O35326 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Srsf5O35326 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Srsf5O35326 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Srsf5O35326 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Srsf5O35326 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Srsf5O35326 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Srsf5O35326 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms