Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scarb2O35114 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scarb2O35114 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scarb2O35114 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scarb2O35114 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scarb2O35114 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scarb2O35114 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scarb2O35114 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scarb2O35114 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scarb2O35114 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Scarb2O35114 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scarb2O35114 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scarb2O35114 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scarb2O35114 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Scarb2O35114 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Scarb2O35114 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scarb2O35114 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scarb2O35114 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Scarb2O35114 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scarb2O35114 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scarb2O35114 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scarb2O35114 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scarb2O35114 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scarb2O35114 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scarb2O35114 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Scarb2O35114 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scarb2O35114 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scarb2O35114 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scarb2O35114 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scarb2O35114 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scarb2O35114 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scarb2O35114 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Scarb2O35114 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scarb2O35114 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scarb2O35114 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scarb2O35114 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scarb2O35114 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scarb2O35114 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scarb2O35114 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scarb2O35114 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scarb2O35114 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scarb2O35114 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scarb2O35114 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scarb2O35114 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scarb2O35114 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scarb2O35114 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scarb2O35114 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scarb2O35114 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Scarb2O35114 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scarb2O35114 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scarb2O35114 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scarb2O35114 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scarb2O35114 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scarb2O35114 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scarb2O35114 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scarb2O35114 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scarb2O35114 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scarb2O35114 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scarb2O35114 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scarb2O35114 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scarb2O35114 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scarb2O35114 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scarb2O35114 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scarb2O35114 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scarb2O35114 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scarb2O35114 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scarb2O35114 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scarb2O35114 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Scarb2O35114 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scarb2O35114 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scarb2O35114 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scarb2O35114 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Scarb2O35114 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scarb2O35114 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scarb2O35114 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scarb2O35114 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scarb2O35114 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scarb2O35114 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scarb2O35114 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scarb2O35114 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scarb2O35114 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scarb2O35114 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scarb2O35114 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scarb2O35114 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scarb2O35114 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scarb2O35114 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scarb2O35114 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scarb2O35114 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scarb2O35114 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scarb2O35114 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scarb2O35114 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scarb2O35114 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scarb2O35114 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scarb2O35114 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scarb2O35114 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scarb2O35114 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scarb2O35114 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Scarb2O35114 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scarb2O35114 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scarb2O35114 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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