Protein–RNA interactions for Protein: O35066

Kif3c, Kinesin-like protein KIF3C, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3cO35066 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kif3cO35066 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kif3cO35066 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Kif3cO35066 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kif3cO35066 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kif3cO35066 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kif3cO35066 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Kif3cO35066 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kif3cO35066 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kif3cO35066 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Kif3cO35066 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kif3cO35066 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kif3cO35066 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Kif3cO35066 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kif3cO35066 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kif3cO35066 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kif3cO35066 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kif3cO35066 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kif3cO35066 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kif3cO35066 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kif3cO35066 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kif3cO35066 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kif3cO35066 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kif3cO35066 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kif3cO35066 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kif3cO35066 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kif3cO35066 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kif3cO35066 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kif3cO35066 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kif3cO35066 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kif3cO35066 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kif3cO35066 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kif3cO35066 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Kif3cO35066 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kif3cO35066 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kif3cO35066 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kif3cO35066 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kif3cO35066 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kif3cO35066 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kif3cO35066 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kif3cO35066 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kif3cO35066 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kif3cO35066 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kif3cO35066 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kif3cO35066 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kif3cO35066 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kif3cO35066 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kif3cO35066 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kif3cO35066 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kif3cO35066 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kif3cO35066 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kif3cO35066 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kif3cO35066 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kif3cO35066 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kif3cO35066 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kif3cO35066 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kif3cO35066 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kif3cO35066 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kif3cO35066 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kif3cO35066 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kif3cO35066 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kif3cO35066 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kif3cO35066 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Kif3cO35066 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kif3cO35066 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kif3cO35066 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Kif3cO35066 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kif3cO35066 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kif3cO35066 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kif3cO35066 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kif3cO35066 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kif3cO35066 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kif3cO35066 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kif3cO35066 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kif3cO35066 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kif3cO35066 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kif3cO35066 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kif3cO35066 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kif3cO35066 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kif3cO35066 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kif3cO35066 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Kif3cO35066 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kif3cO35066 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kif3cO35066 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Kif3cO35066 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kif3cO35066 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kif3cO35066 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kif3cO35066 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kif3cO35066 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kif3cO35066 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kif3cO35066 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kif3cO35066 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kif3cO35066 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kif3cO35066 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kif3cO35066 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kif3cO35066 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kif3cO35066 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kif3cO35066 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kif3cO35066 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kif3cO35066 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms