Protein–RNA interactions for Protein: O08967

Cyth3, Cytohesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyth3O08967 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyth3O08967 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyth3O08967 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyth3O08967 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyth3O08967 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyth3O08967 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyth3O08967 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyth3O08967 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyth3O08967 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyth3O08967 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyth3O08967 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyth3O08967 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyth3O08967 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyth3O08967 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyth3O08967 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyth3O08967 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyth3O08967 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyth3O08967 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyth3O08967 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyth3O08967 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyth3O08967 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyth3O08967 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyth3O08967 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyth3O08967 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyth3O08967 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyth3O08967 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyth3O08967 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyth3O08967 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyth3O08967 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyth3O08967 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyth3O08967 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyth3O08967 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyth3O08967 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyth3O08967 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyth3O08967 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyth3O08967 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyth3O08967 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyth3O08967 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyth3O08967 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyth3O08967 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cyth3O08967 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyth3O08967 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyth3O08967 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyth3O08967 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyth3O08967 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyth3O08967 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyth3O08967 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyth3O08967 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyth3O08967 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyth3O08967 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyth3O08967 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyth3O08967 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyth3O08967 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyth3O08967 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyth3O08967 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyth3O08967 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyth3O08967 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyth3O08967 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyth3O08967 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyth3O08967 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyth3O08967 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyth3O08967 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyth3O08967 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyth3O08967 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyth3O08967 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyth3O08967 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyth3O08967 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyth3O08967 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyth3O08967 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyth3O08967 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cyth3O08967 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cyth3O08967 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cyth3O08967 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cyth3O08967 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cyth3O08967 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cyth3O08967 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cyth3O08967 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyth3O08967 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyth3O08967 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyth3O08967 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyth3O08967 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyth3O08967 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyth3O08967 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyth3O08967 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyth3O08967 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyth3O08967 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyth3O08967 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyth3O08967 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyth3O08967 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyth3O08967 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyth3O08967 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyth3O08967 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyth3O08967 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyth3O08967 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyth3O08967 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyth3O08967 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyth3O08967 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyth3O08967 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyth3O08967 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyth3O08967 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.4 ms