Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Efna3O08545 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Efna3O08545 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efna3O08545 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efna3O08545 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efna3O08545 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efna3O08545 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efna3O08545 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efna3O08545 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efna3O08545 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efna3O08545 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efna3O08545 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efna3O08545 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efna3O08545 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efna3O08545 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efna3O08545 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efna3O08545 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efna3O08545 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efna3O08545 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efna3O08545 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efna3O08545 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efna3O08545 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efna3O08545 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efna3O08545 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efna3O08545 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efna3O08545 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efna3O08545 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efna3O08545 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efna3O08545 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efna3O08545 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efna3O08545 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efna3O08545 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efna3O08545 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efna3O08545 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efna3O08545 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efna3O08545 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Efna3O08545 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efna3O08545 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efna3O08545 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efna3O08545 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efna3O08545 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efna3O08545 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efna3O08545 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Efna3O08545 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efna3O08545 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efna3O08545 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efna3O08545 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efna3O08545 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efna3O08545 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efna3O08545 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efna3O08545 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efna3O08545 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efna3O08545 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efna3O08545 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Efna3O08545 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efna3O08545 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efna3O08545 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efna3O08545 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efna3O08545 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efna3O08545 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efna3O08545 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efna3O08545 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efna3O08545 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efna3O08545 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efna3O08545 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efna3O08545 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efna3O08545 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efna3O08545 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efna3O08545 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efna3O08545 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efna3O08545 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efna3O08545 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efna3O08545 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efna3O08545 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efna3O08545 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efna3O08545 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efna3O08545 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efna3O08545 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efna3O08545 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efna3O08545 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Efna3O08545 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Efna3O08545 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Efna3O08545 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Efna3O08545 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Efna3O08545 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Efna3O08545 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Efna3O08545 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Efna3O08545 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Efna3O08545 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Efna3O08545 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Efna3O08545 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Efna3O08545 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Efna3O08545 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Efna3O08545 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Efna3O08545 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Efna3O08545 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Efna3O08545 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Efna3O08545 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Efna3O08545 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efna3O08545 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms