Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3542K7N6U2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3542K7N6U2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm3542K7N6U2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3542K7N6U2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3542K7N6U2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3542K7N6U2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3542K7N6U2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3542K7N6U2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3542K7N6U2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3542K7N6U2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3542K7N6U2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3542K7N6U2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3542K7N6U2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3542K7N6U2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3542K7N6U2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3542K7N6U2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3542K7N6U2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3542K7N6U2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3542K7N6U2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3542K7N6U2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3542K7N6U2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3542K7N6U2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm3542K7N6U2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3542K7N6U2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3542K7N6U2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3542K7N6U2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3542K7N6U2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm3542K7N6U2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3542K7N6U2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3542K7N6U2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3542K7N6U2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3542K7N6U2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3542K7N6U2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3542K7N6U2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3542K7N6U2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3542K7N6U2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm3542K7N6U2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3542K7N6U2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3542K7N6U2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3542K7N6U2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3542K7N6U2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3542K7N6U2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3542K7N6U2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm3542K7N6U2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm3542K7N6U2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm3542K7N6U2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3542K7N6U2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3542K7N6U2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3542K7N6U2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3542K7N6U2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3542K7N6U2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3542K7N6U2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3542K7N6U2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3542K7N6U2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm3542K7N6U2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3542K7N6U2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3542K7N6U2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3542K7N6U2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3542K7N6U2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3542K7N6U2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3542K7N6U2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3542K7N6U2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3542K7N6U2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm3542K7N6U2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3542K7N6U2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3542K7N6U2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3542K7N6U2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3542K7N6U2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm3542K7N6U2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3542K7N6U2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3542K7N6U2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3542K7N6U2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3542K7N6U2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3542K7N6U2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3542K7N6U2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3542K7N6U2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm3542K7N6U2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3542K7N6U2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3542K7N6U2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3542K7N6U2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3542K7N6U2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3542K7N6U2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3542K7N6U2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3542K7N6U2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3542K7N6U2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3542K7N6U2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3542K7N6U2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3542K7N6U2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3542K7N6U2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3542K7N6U2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3542K7N6U2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3542K7N6U2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3542K7N6U2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3542K7N6U2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3542K7N6U2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3542K7N6U2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3542K7N6U2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3542K7N6U2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3542K7N6U2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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