Protein–RNA interactions for Protein: J3QPP2

Gm3685, Predicted gene 3685, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3685J3QPP2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm3685J3QPP2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm3685J3QPP2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm3685J3QPP2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm3685J3QPP2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm3685J3QPP2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3685J3QPP2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3685J3QPP2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3685J3QPP2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3685J3QPP2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3685J3QPP2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3685J3QPP2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3685J3QPP2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3685J3QPP2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3685J3QPP2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3685J3QPP2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3685J3QPP2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3685J3QPP2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3685J3QPP2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3685J3QPP2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3685J3QPP2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3685J3QPP2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3685J3QPP2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3685J3QPP2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3685J3QPP2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3685J3QPP2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3685J3QPP2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3685J3QPP2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3685J3QPP2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3685J3QPP2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3685J3QPP2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3685J3QPP2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3685J3QPP2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3685J3QPP2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3685J3QPP2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3685J3QPP2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3685J3QPP2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3685J3QPP2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3685J3QPP2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3685J3QPP2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3685J3QPP2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3685J3QPP2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3685J3QPP2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3685J3QPP2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3685J3QPP2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3685J3QPP2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3685J3QPP2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3685J3QPP2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3685J3QPP2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3685J3QPP2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3685J3QPP2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms