Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mfsd4b4J3QNS5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mfsd4b4J3QNS5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Mfsd4b4J3QNS5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mfsd4b4J3QNS5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mfsd4b4J3QNS5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mfsd4b4J3QNS5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mfsd4b4J3QNS5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mfsd4b4J3QNS5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mfsd4b4J3QNS5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Mfsd4b4J3QNS5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mfsd4b4J3QNS5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mfsd4b4J3QNS5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mfsd4b4J3QNS5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mfsd4b4J3QNS5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mfsd4b4J3QNS5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mfsd4b4J3QNS5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mfsd4b4J3QNS5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mfsd4b4J3QNS5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mfsd4b4J3QNS5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mfsd4b4J3QNS5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mfsd4b4J3QNS5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mfsd4b4J3QNS5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mfsd4b4J3QNS5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Mfsd4b4J3QNS5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mfsd4b4J3QNS5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Mfsd4b4J3QNS5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mfsd4b4J3QNS5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mfsd4b4J3QNS5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mfsd4b4J3QNS5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mfsd4b4J3QNS5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mfsd4b4J3QNS5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mfsd4b4J3QNS5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mfsd4b4J3QNS5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mfsd4b4J3QNS5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mfsd4b4J3QNS5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mfsd4b4J3QNS5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mfsd4b4J3QNS5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mfsd4b4J3QNS5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mfsd4b4J3QNS5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mfsd4b4J3QNS5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mfsd4b4J3QNS5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mfsd4b4J3QNS5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mfsd4b4J3QNS5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mfsd4b4J3QNS5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mfsd4b4J3QNS5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Mfsd4b4J3QNS5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Mfsd4b4J3QNS5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mfsd4b4J3QNS5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mfsd4b4J3QNS5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mfsd4b4J3QNS5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mfsd4b4J3QNS5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mfsd4b4J3QNS5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mfsd4b4J3QNS5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mfsd4b4J3QNS5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mfsd4b4J3QNS5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mfsd4b4J3QNS5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mfsd4b4J3QNS5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mfsd4b4J3QNS5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mfsd4b4J3QNS5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mfsd4b4J3QNS5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mfsd4b4J3QNS5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Mfsd4b4J3QNS5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mfsd4b4J3QNS5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mfsd4b4J3QNS5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Mfsd4b4J3QNS5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mfsd4b4J3QNS5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mfsd4b4J3QNS5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mfsd4b4J3QNS5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mfsd4b4J3QNS5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mfsd4b4J3QNS5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Mfsd4b4J3QNS5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mfsd4b4J3QNS5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mfsd4b4J3QNS5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Mfsd4b4J3QNS5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mfsd4b4J3QNS5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Mfsd4b4J3QNS5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mfsd4b4J3QNS5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mfsd4b4J3QNS5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mfsd4b4J3QNS5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mfsd4b4J3QNS5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mfsd4b4J3QNS5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mfsd4b4J3QNS5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mfsd4b4J3QNS5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mfsd4b4J3QNS5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mfsd4b4J3QNS5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mfsd4b4J3QNS5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mfsd4b4J3QNS5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mfsd4b4J3QNS5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mfsd4b4J3QNS5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mfsd4b4J3QNS5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mfsd4b4J3QNS5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mfsd4b4J3QNS5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mfsd4b4J3QNS5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mfsd4b4J3QNS5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mfsd4b4J3QNS5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mfsd4b4J3QNS5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mfsd4b4J3QNS5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mfsd4b4J3QNS5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms