Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
Ccdc180J3QNE4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
Ccdc180J3QNE4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Ccdc180J3QNE4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
Ccdc180J3QNE4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Ccdc180J3QNE4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
Ccdc180J3QNE4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Ccdc180J3QNE4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC40.66■■■■■ 4.1
Ccdc180J3QNE4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Ccdc180J3QNE4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
Ccdc180J3QNE4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
Ccdc180J3QNE4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC40.64■■■■■ 4.1
Ccdc180J3QNE4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Ccdc180J3QNE4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Ccdc180J3QNE4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Ccdc180J3QNE4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.1
Ccdc180J3QNE4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Ccdc180J3QNE4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
Ccdc180J3QNE4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Ccdc180J3QNE4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Ccdc180J3QNE4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC40.6■■■■■ 4.09
Ccdc180J3QNE4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Ccdc180J3QNE4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
Ccdc180J3QNE4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
Ccdc180J3QNE4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Ccdc180J3QNE4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
Ccdc180J3QNE4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC40.59■■■■■ 4.09
Ccdc180J3QNE4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Ccdc180J3QNE4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Ccdc180J3QNE4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Ccdc180J3QNE4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Ccdc180J3QNE4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC40.58■■■■■ 4.09
Ccdc180J3QNE4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
Ccdc180J3QNE4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
Ccdc180J3QNE4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC40.56■■■■■ 4.08
Ccdc180J3QNE4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC40.56■■■■■ 4.08
Ccdc180J3QNE4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Ccdc180J3QNE4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Ccdc180J3QNE4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
Ccdc180J3QNE4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Ccdc180J3QNE4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Ccdc180J3QNE4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Ccdc180J3QNE4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC40.55■■■■■ 4.08
Ccdc180J3QNE4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Ccdc180J3QNE4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
Ccdc180J3QNE4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Ccdc180J3QNE4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
Ccdc180J3QNE4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Ccdc180J3QNE4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
Ccdc180J3QNE4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Ccdc180J3QNE4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
Ccdc180J3QNE4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Ccdc180J3QNE4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Ccdc180J3QNE4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Ccdc180J3QNE4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Ccdc180J3QNE4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.07
Ccdc180J3QNE4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.07
Ccdc180J3QNE4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
Ccdc180J3QNE4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
Ccdc180J3QNE4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Ccdc180J3QNE4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
Ccdc180J3QNE4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Ccdc180J3QNE4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Ccdc180J3QNE4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Ccdc180J3QNE4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Ccdc180J3QNE4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC40.49■■■■■ 4.07
Ccdc180J3QNE4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Ccdc180J3QNE4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Ccdc180J3QNE4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Ccdc180J3QNE4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Ccdc180J3QNE4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
Ccdc180J3QNE4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
Ccdc180J3QNE4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Ccdc180J3QNE4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Ccdc180J3QNE4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
Ccdc180J3QNE4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.07
Ccdc180J3QNE4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Ccdc180J3QNE4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Ccdc180J3QNE4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
Ccdc180J3QNE4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Ccdc180J3QNE4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
Ccdc180J3QNE4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Ccdc180J3QNE4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Ccdc180J3QNE4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Ccdc180J3QNE4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
Ccdc180J3QNE4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Ccdc180J3QNE4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Ccdc180J3QNE4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
Ccdc180J3QNE4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Ccdc180J3QNE4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
Ccdc180J3QNE4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC40.4■■■■■ 4.06
Ccdc180J3QNE4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC40.39■■■■■ 4.06
Ccdc180J3QNE4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Ccdc180J3QNE4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Ccdc180J3QNE4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Ccdc180J3QNE4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
Ccdc180J3QNE4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
Ccdc180J3QNE4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
Ccdc180J3QNE4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Ccdc180J3QNE4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 183 ms