Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn34c3J3QJW5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn34c3J3QJW5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn34c3J3QJW5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn34c3J3QJW5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cldn34c3J3QJW5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn34c3J3QJW5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn34c3J3QJW5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn34c3J3QJW5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn34c3J3QJW5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cldn34c3J3QJW5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn34c3J3QJW5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn34c3J3QJW5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn34c3J3QJW5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn34c3J3QJW5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn34c3J3QJW5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn34c3J3QJW5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn34c3J3QJW5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn34c3J3QJW5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn34c3J3QJW5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn34c3J3QJW5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn34c3J3QJW5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn34c3J3QJW5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn34c3J3QJW5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn34c3J3QJW5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn34c3J3QJW5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn34c3J3QJW5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn34c3J3QJW5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn34c3J3QJW5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn34c3J3QJW5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn34c3J3QJW5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn34c3J3QJW5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn34c3J3QJW5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn34c3J3QJW5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn34c3J3QJW5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn34c3J3QJW5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn34c3J3QJW5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn34c3J3QJW5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn34c3J3QJW5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn34c3J3QJW5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn34c3J3QJW5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn34c3J3QJW5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn34c3J3QJW5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn34c3J3QJW5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn34c3J3QJW5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn34c3J3QJW5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn34c3J3QJW5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn34c3J3QJW5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn34c3J3QJW5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn34c3J3QJW5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn34c3J3QJW5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn34c3J3QJW5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn34c3J3QJW5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn34c3J3QJW5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn34c3J3QJW5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn34c3J3QJW5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn34c3J3QJW5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn34c3J3QJW5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn34c3J3QJW5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn34c3J3QJW5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn34c3J3QJW5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn34c3J3QJW5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn34c3J3QJW5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn34c3J3QJW5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn34c3J3QJW5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn34c3J3QJW5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn34c3J3QJW5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34c3J3QJW5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34c3J3QJW5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn34c3J3QJW5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34c3J3QJW5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34c3J3QJW5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34c3J3QJW5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34c3J3QJW5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34c3J3QJW5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34c3J3QJW5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34c3J3QJW5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34c3J3QJW5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34c3J3QJW5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn34c3J3QJW5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34c3J3QJW5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34c3J3QJW5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34c3J3QJW5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34c3J3QJW5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34c3J3QJW5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34c3J3QJW5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34c3J3QJW5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34c3J3QJW5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34c3J3QJW5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34c3J3QJW5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34c3J3QJW5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34c3J3QJW5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn34c3J3QJW5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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