Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm20828J3KMI7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm20828J3KMI7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm20828J3KMI7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm20828J3KMI7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm20828J3KMI7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm20828J3KMI7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm20828J3KMI7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm20828J3KMI7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm20828J3KMI7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm20828J3KMI7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm20828J3KMI7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm20828J3KMI7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm20828J3KMI7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm20828J3KMI7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm20828J3KMI7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm20828J3KMI7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm20828J3KMI7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm20828J3KMI7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm20828J3KMI7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm20828J3KMI7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm20828J3KMI7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm20828J3KMI7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm20828J3KMI7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm20828J3KMI7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm20828J3KMI7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm20828J3KMI7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm20828J3KMI7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm20828J3KMI7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm20828J3KMI7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm20828J3KMI7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm20828J3KMI7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm20828J3KMI7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm20828J3KMI7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm20828J3KMI7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm20828J3KMI7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm20828J3KMI7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm20828J3KMI7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm20828J3KMI7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm20828J3KMI7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm20828J3KMI7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20828J3KMI7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20828J3KMI7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20828J3KMI7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20828J3KMI7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20828J3KMI7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20828J3KMI7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20828J3KMI7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm20828J3KMI7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm20828J3KMI7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm20828J3KMI7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm20828J3KMI7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm20828J3KMI7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm20828J3KMI7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm20828J3KMI7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm20828J3KMI7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm20828J3KMI7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm20828J3KMI7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm20828J3KMI7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm20828J3KMI7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm20828J3KMI7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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