Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pot1bH7BX60 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pot1bH7BX60 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pot1bH7BX60 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pot1bH7BX60 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pot1bH7BX60 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pot1bH7BX60 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pot1bH7BX60 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pot1bH7BX60 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pot1bH7BX60 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pot1bH7BX60 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pot1bH7BX60 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pot1bH7BX60 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pot1bH7BX60 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pot1bH7BX60 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pot1bH7BX60 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pot1bH7BX60 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pot1bH7BX60 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pot1bH7BX60 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pot1bH7BX60 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pot1bH7BX60 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pot1bH7BX60 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pot1bH7BX60 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pot1bH7BX60 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pot1bH7BX60 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pot1bH7BX60 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pot1bH7BX60 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pot1bH7BX60 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pot1bH7BX60 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pot1bH7BX60 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pot1bH7BX60 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pot1bH7BX60 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pot1bH7BX60 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pot1bH7BX60 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pot1bH7BX60 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pot1bH7BX60 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pot1bH7BX60 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pot1bH7BX60 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pot1bH7BX60 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pot1bH7BX60 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pot1bH7BX60 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pot1bH7BX60 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pot1bH7BX60 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pot1bH7BX60 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pot1bH7BX60 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pot1bH7BX60 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pot1bH7BX60 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pot1bH7BX60 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pot1bH7BX60 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pot1bH7BX60 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pot1bH7BX60 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pot1bH7BX60 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pot1bH7BX60 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pot1bH7BX60 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pot1bH7BX60 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pot1bH7BX60 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pot1bH7BX60 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pot1bH7BX60 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pot1bH7BX60 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pot1bH7BX60 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pot1bH7BX60 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pot1bH7BX60 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pot1bH7BX60 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pot1bH7BX60 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pot1bH7BX60 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pot1bH7BX60 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pot1bH7BX60 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pot1bH7BX60 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Pot1bH7BX60 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Pot1bH7BX60 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pot1bH7BX60 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pot1bH7BX60 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pot1bH7BX60 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pot1bH7BX60 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pot1bH7BX60 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pot1bH7BX60 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pot1bH7BX60 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pot1bH7BX60 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pot1bH7BX60 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pot1bH7BX60 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pot1bH7BX60 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pot1bH7BX60 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pot1bH7BX60 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pot1bH7BX60 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pot1bH7BX60 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Pot1bH7BX60 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pot1bH7BX60 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pot1bH7BX60 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pot1bH7BX60 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pot1bH7BX60 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pot1bH7BX60 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pot1bH7BX60 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pot1bH7BX60 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pot1bH7BX60 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pot1bH7BX60 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pot1bH7BX60 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pot1bH7BX60 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pot1bH7BX60 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pot1bH7BX60 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pot1bH7BX60 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms