Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp17lcG5E8I7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp17lcG5E8I7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp17lcG5E8I7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp17lcG5E8I7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp17lcG5E8I7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp17lcG5E8I7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp17lcG5E8I7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp17lcG5E8I7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp17lcG5E8I7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp17lcG5E8I7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp17lcG5E8I7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp17lcG5E8I7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp17lcG5E8I7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp17lcG5E8I7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp17lcG5E8I7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp17lcG5E8I7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp17lcG5E8I7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp17lcG5E8I7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp17lcG5E8I7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp17lcG5E8I7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp17lcG5E8I7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp17lcG5E8I7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp17lcG5E8I7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp17lcG5E8I7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp17lcG5E8I7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp17lcG5E8I7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp17lcG5E8I7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp17lcG5E8I7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp17lcG5E8I7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp17lcG5E8I7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp17lcG5E8I7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp17lcG5E8I7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp17lcG5E8I7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp17lcG5E8I7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp17lcG5E8I7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp17lcG5E8I7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp17lcG5E8I7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp17lcG5E8I7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp17lcG5E8I7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp17lcG5E8I7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp17lcG5E8I7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp17lcG5E8I7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Usp17lcG5E8I7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp17lcG5E8I7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp17lcG5E8I7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp17lcG5E8I7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp17lcG5E8I7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp17lcG5E8I7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp17lcG5E8I7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp17lcG5E8I7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp17lcG5E8I7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp17lcG5E8I7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp17lcG5E8I7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp17lcG5E8I7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp17lcG5E8I7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp17lcG5E8I7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp17lcG5E8I7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp17lcG5E8I7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp17lcG5E8I7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp17lcG5E8I7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp17lcG5E8I7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp17lcG5E8I7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp17lcG5E8I7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp17lcG5E8I7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp17lcG5E8I7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp17lcG5E8I7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp17lcG5E8I7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp17lcG5E8I7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp17lcG5E8I7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp17lcG5E8I7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp17lcG5E8I7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp17lcG5E8I7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp17lcG5E8I7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp17lcG5E8I7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp17lcG5E8I7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp17lcG5E8I7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp17lcG5E8I7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp17lcG5E8I7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp17lcG5E8I7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp17lcG5E8I7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp17lcG5E8I7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp17lcG5E8I7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp17lcG5E8I7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp17lcG5E8I7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp17lcG5E8I7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp17lcG5E8I7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp17lcG5E8I7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp17lcG5E8I7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp17lcG5E8I7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp17lcG5E8I7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp17lcG5E8I7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp17lcG5E8I7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp17lcG5E8I7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp17lcG5E8I7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp17lcG5E8I7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp17lcG5E8I7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp17lcG5E8I7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp17lcG5E8I7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp17lcG5E8I7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
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