Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn34aG3UW52 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn34aG3UW52 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn34aG3UW52 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn34aG3UW52 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn34aG3UW52 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn34aG3UW52 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn34aG3UW52 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn34aG3UW52 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn34aG3UW52 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn34aG3UW52 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn34aG3UW52 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn34aG3UW52 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn34aG3UW52 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn34aG3UW52 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn34aG3UW52 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn34aG3UW52 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn34aG3UW52 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn34aG3UW52 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn34aG3UW52 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn34aG3UW52 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn34aG3UW52 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn34aG3UW52 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn34aG3UW52 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn34aG3UW52 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn34aG3UW52 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn34aG3UW52 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn34aG3UW52 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn34aG3UW52 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn34aG3UW52 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn34aG3UW52 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn34aG3UW52 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn34aG3UW52 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn34aG3UW52 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn34aG3UW52 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn34aG3UW52 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn34aG3UW52 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn34aG3UW52 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn34aG3UW52 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn34aG3UW52 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn34aG3UW52 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn34aG3UW52 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn34aG3UW52 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn34aG3UW52 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn34aG3UW52 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn34aG3UW52 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn34aG3UW52 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn34aG3UW52 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn34aG3UW52 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn34aG3UW52 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn34aG3UW52 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn34aG3UW52 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn34aG3UW52 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn34aG3UW52 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn34aG3UW52 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn34aG3UW52 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn34aG3UW52 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn34aG3UW52 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn34aG3UW52 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn34aG3UW52 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn34aG3UW52 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn34aG3UW52 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn34aG3UW52 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn34aG3UW52 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn34aG3UW52 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn34aG3UW52 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn34aG3UW52 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn34aG3UW52 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn34aG3UW52 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn34aG3UW52 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn34aG3UW52 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn34aG3UW52 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Cldn34aG3UW52 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cldn34aG3UW52 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn34aG3UW52 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn34aG3UW52 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn34aG3UW52 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn34aG3UW52 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn34aG3UW52 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn34aG3UW52 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn34aG3UW52 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn34aG3UW52 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn34aG3UW52 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn34aG3UW52 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn34aG3UW52 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn34aG3UW52 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn34aG3UW52 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn34aG3UW52 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn34aG3UW52 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn34aG3UW52 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn34aG3UW52 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn34aG3UW52 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn34aG3UW52 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn34aG3UW52 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn34aG3UW52 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn34aG3UW52 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn34aG3UW52 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn34aG3UW52 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn34aG3UW52 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn34aG3UW52 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms