Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9S8

Gm2564, C-C motif chemokine, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2564F6Z9S8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm2564F6Z9S8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2564F6Z9S8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2564F6Z9S8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2564F6Z9S8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2564F6Z9S8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2564F6Z9S8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2564F6Z9S8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms