Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Raph1F2Z3U3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Raph1F2Z3U3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Raph1F2Z3U3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Raph1F2Z3U3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Raph1F2Z3U3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Raph1F2Z3U3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Raph1F2Z3U3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Raph1F2Z3U3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Raph1F2Z3U3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Raph1F2Z3U3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Raph1F2Z3U3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Raph1F2Z3U3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Raph1F2Z3U3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Raph1F2Z3U3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Raph1F2Z3U3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Raph1F2Z3U3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Raph1F2Z3U3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Raph1F2Z3U3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Raph1F2Z3U3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Raph1F2Z3U3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Raph1F2Z3U3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Raph1F2Z3U3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Raph1F2Z3U3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Raph1F2Z3U3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Raph1F2Z3U3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Raph1F2Z3U3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Raph1F2Z3U3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Raph1F2Z3U3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Raph1F2Z3U3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Raph1F2Z3U3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Raph1F2Z3U3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Raph1F2Z3U3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Raph1F2Z3U3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Raph1F2Z3U3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Raph1F2Z3U3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Raph1F2Z3U3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Raph1F2Z3U3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Raph1F2Z3U3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Raph1F2Z3U3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Raph1F2Z3U3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Raph1F2Z3U3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Raph1F2Z3U3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Raph1F2Z3U3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Raph1F2Z3U3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Raph1F2Z3U3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Raph1F2Z3U3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Raph1F2Z3U3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Raph1F2Z3U3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Raph1F2Z3U3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Raph1F2Z3U3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Raph1F2Z3U3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Raph1F2Z3U3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Raph1F2Z3U3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Raph1F2Z3U3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Raph1F2Z3U3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Raph1F2Z3U3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Raph1F2Z3U3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Raph1F2Z3U3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Raph1F2Z3U3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Raph1F2Z3U3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Raph1F2Z3U3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Raph1F2Z3U3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Raph1F2Z3U3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Raph1F2Z3U3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Raph1F2Z3U3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Raph1F2Z3U3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Raph1F2Z3U3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Raph1F2Z3U3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Raph1F2Z3U3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Raph1F2Z3U3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Raph1F2Z3U3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Raph1F2Z3U3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Raph1F2Z3U3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Raph1F2Z3U3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Raph1F2Z3U3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Raph1F2Z3U3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Raph1F2Z3U3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Raph1F2Z3U3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Raph1F2Z3U3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Raph1F2Z3U3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Raph1F2Z3U3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Raph1F2Z3U3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Raph1F2Z3U3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Raph1F2Z3U3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Raph1F2Z3U3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Raph1F2Z3U3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Raph1F2Z3U3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Raph1F2Z3U3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Raph1F2Z3U3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Raph1F2Z3U3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Raph1F2Z3U3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Raph1F2Z3U3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Raph1F2Z3U3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Raph1F2Z3U3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Raph1F2Z3U3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Raph1F2Z3U3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Raph1F2Z3U3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Raph1F2Z3U3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Raph1F2Z3U3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms