Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdzd7E9Q9W7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdzd7E9Q9W7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdzd7E9Q9W7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdzd7E9Q9W7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdzd7E9Q9W7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzd7E9Q9W7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzd7E9Q9W7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdzd7E9Q9W7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pdzd7E9Q9W7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pdzd7E9Q9W7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pdzd7E9Q9W7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdzd7E9Q9W7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdzd7E9Q9W7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdzd7E9Q9W7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdzd7E9Q9W7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdzd7E9Q9W7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdzd7E9Q9W7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdzd7E9Q9W7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdzd7E9Q9W7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdzd7E9Q9W7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdzd7E9Q9W7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdzd7E9Q9W7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdzd7E9Q9W7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdzd7E9Q9W7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdzd7E9Q9W7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdzd7E9Q9W7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdzd7E9Q9W7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzd7E9Q9W7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzd7E9Q9W7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzd7E9Q9W7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzd7E9Q9W7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdzd7E9Q9W7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdzd7E9Q9W7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdzd7E9Q9W7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdzd7E9Q9W7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdzd7E9Q9W7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdzd7E9Q9W7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdzd7E9Q9W7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdzd7E9Q9W7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdzd7E9Q9W7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdzd7E9Q9W7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdzd7E9Q9W7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdzd7E9Q9W7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdzd7E9Q9W7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdzd7E9Q9W7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdzd7E9Q9W7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdzd7E9Q9W7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdzd7E9Q9W7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdzd7E9Q9W7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdzd7E9Q9W7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdzd7E9Q9W7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdzd7E9Q9W7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdzd7E9Q9W7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdzd7E9Q9W7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdzd7E9Q9W7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdzd7E9Q9W7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdzd7E9Q9W7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdzd7E9Q9W7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdzd7E9Q9W7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdzd7E9Q9W7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdzd7E9Q9W7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdzd7E9Q9W7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdzd7E9Q9W7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdzd7E9Q9W7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdzd7E9Q9W7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdzd7E9Q9W7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdzd7E9Q9W7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdzd7E9Q9W7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdzd7E9Q9W7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdzd7E9Q9W7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdzd7E9Q9W7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdzd7E9Q9W7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdzd7E9Q9W7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdzd7E9Q9W7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdzd7E9Q9W7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdzd7E9Q9W7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdzd7E9Q9W7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdzd7E9Q9W7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdzd7E9Q9W7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdzd7E9Q9W7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdzd7E9Q9W7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdzd7E9Q9W7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdzd7E9Q9W7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdzd7E9Q9W7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzd7E9Q9W7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzd7E9Q9W7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzd7E9Q9W7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzd7E9Q9W7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzd7E9Q9W7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzd7E9Q9W7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzd7E9Q9W7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdzd7E9Q9W7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdzd7E9Q9W7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdzd7E9Q9W7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzd7E9Q9W7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzd7E9Q9W7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzd7E9Q9W7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzd7E9Q9W7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzd7E9Q9W7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms