Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh18E9Q9Q6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh18E9Q9Q6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh18E9Q9Q6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh18E9Q9Q6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh18E9Q9Q6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh18E9Q9Q6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh18E9Q9Q6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh18E9Q9Q6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh18E9Q9Q6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh18E9Q9Q6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh18E9Q9Q6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh18E9Q9Q6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh18E9Q9Q6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh18E9Q9Q6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh18E9Q9Q6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh18E9Q9Q6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh18E9Q9Q6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh18E9Q9Q6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh18E9Q9Q6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh18E9Q9Q6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh18E9Q9Q6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh18E9Q9Q6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh18E9Q9Q6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cdh18E9Q9Q6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh18E9Q9Q6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh18E9Q9Q6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh18E9Q9Q6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh18E9Q9Q6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh18E9Q9Q6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh18E9Q9Q6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh18E9Q9Q6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh18E9Q9Q6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh18E9Q9Q6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh18E9Q9Q6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh18E9Q9Q6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh18E9Q9Q6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh18E9Q9Q6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh18E9Q9Q6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh18E9Q9Q6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh18E9Q9Q6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh18E9Q9Q6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh18E9Q9Q6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh18E9Q9Q6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh18E9Q9Q6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh18E9Q9Q6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh18E9Q9Q6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh18E9Q9Q6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh18E9Q9Q6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cdh18E9Q9Q6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cdh18E9Q9Q6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cdh18E9Q9Q6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh18E9Q9Q6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh18E9Q9Q6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh18E9Q9Q6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh18E9Q9Q6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh18E9Q9Q6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh18E9Q9Q6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh18E9Q9Q6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh18E9Q9Q6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh18E9Q9Q6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh18E9Q9Q6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh18E9Q9Q6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh18E9Q9Q6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh18E9Q9Q6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh18E9Q9Q6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh18E9Q9Q6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh18E9Q9Q6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh18E9Q9Q6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh18E9Q9Q6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh18E9Q9Q6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh18E9Q9Q6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh18E9Q9Q6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh18E9Q9Q6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh18E9Q9Q6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh18E9Q9Q6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh18E9Q9Q6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh18E9Q9Q6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh18E9Q9Q6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh18E9Q9Q6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh18E9Q9Q6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh18E9Q9Q6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh18E9Q9Q6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh18E9Q9Q6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh18E9Q9Q6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh18E9Q9Q6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh18E9Q9Q6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh18E9Q9Q6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh18E9Q9Q6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh18E9Q9Q6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdh18E9Q9Q6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdh18E9Q9Q6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdh18E9Q9Q6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdh18E9Q9Q6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdh18E9Q9Q6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdh18E9Q9Q6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdh18E9Q9Q6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdh18E9Q9Q6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdh18E9Q9Q6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdh18E9Q9Q6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms