Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc146E9Q9F7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc146E9Q9F7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc146E9Q9F7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc146E9Q9F7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc146E9Q9F7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc146E9Q9F7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc146E9Q9F7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc146E9Q9F7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc146E9Q9F7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc146E9Q9F7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc146E9Q9F7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc146E9Q9F7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc146E9Q9F7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc146E9Q9F7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc146E9Q9F7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc146E9Q9F7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc146E9Q9F7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc146E9Q9F7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc146E9Q9F7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc146E9Q9F7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc146E9Q9F7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc146E9Q9F7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc146E9Q9F7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc146E9Q9F7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc146E9Q9F7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc146E9Q9F7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc146E9Q9F7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc146E9Q9F7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc146E9Q9F7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc146E9Q9F7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc146E9Q9F7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc146E9Q9F7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc146E9Q9F7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc146E9Q9F7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc146E9Q9F7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc146E9Q9F7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc146E9Q9F7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc146E9Q9F7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc146E9Q9F7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc146E9Q9F7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc146E9Q9F7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc146E9Q9F7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc146E9Q9F7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc146E9Q9F7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc146E9Q9F7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc146E9Q9F7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc146E9Q9F7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc146E9Q9F7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc146E9Q9F7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc146E9Q9F7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc146E9Q9F7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc146E9Q9F7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc146E9Q9F7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc146E9Q9F7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc146E9Q9F7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc146E9Q9F7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc146E9Q9F7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc146E9Q9F7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc146E9Q9F7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc146E9Q9F7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc146E9Q9F7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc146E9Q9F7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc146E9Q9F7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc146E9Q9F7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc146E9Q9F7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc146E9Q9F7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc146E9Q9F7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc146E9Q9F7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc146E9Q9F7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc146E9Q9F7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc146E9Q9F7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc146E9Q9F7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc146E9Q9F7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc146E9Q9F7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc146E9Q9F7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc146E9Q9F7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc146E9Q9F7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc146E9Q9F7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc146E9Q9F7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc146E9Q9F7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc146E9Q9F7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc146E9Q9F7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc146E9Q9F7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc146E9Q9F7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc146E9Q9F7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc146E9Q9F7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc146E9Q9F7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc146E9Q9F7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc146E9Q9F7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc146E9Q9F7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc146E9Q9F7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc146E9Q9F7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc146E9Q9F7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc146E9Q9F7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc146E9Q9F7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc146E9Q9F7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc146E9Q9F7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc146E9Q9F7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc146E9Q9F7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms