Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P9

Cdhr2, Cadherin-related family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdhr2E9Q7P9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cdhr2E9Q7P9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cdhr2E9Q7P9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cdhr2E9Q7P9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Cdhr2E9Q7P9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cdhr2E9Q7P9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cdhr2E9Q7P9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cdhr2E9Q7P9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cdhr2E9Q7P9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cdhr2E9Q7P9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cdhr2E9Q7P9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cdhr2E9Q7P9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cdhr2E9Q7P9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cdhr2E9Q7P9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cdhr2E9Q7P9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cdhr2E9Q7P9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Cdhr2E9Q7P9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cdhr2E9Q7P9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cdhr2E9Q7P9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cdhr2E9Q7P9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cdhr2E9Q7P9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cdhr2E9Q7P9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cdhr2E9Q7P9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
Cdhr2E9Q7P9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cdhr2E9Q7P9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cdhr2E9Q7P9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cdhr2E9Q7P9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cdhr2E9Q7P9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdhr2E9Q7P9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdhr2E9Q7P9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdhr2E9Q7P9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdhr2E9Q7P9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdhr2E9Q7P9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cdhr2E9Q7P9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cdhr2E9Q7P9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cdhr2E9Q7P9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cdhr2E9Q7P9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cdhr2E9Q7P9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cdhr2E9Q7P9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cdhr2E9Q7P9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Cdhr2E9Q7P9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cdhr2E9Q7P9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cdhr2E9Q7P9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cdhr2E9Q7P9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cdhr2E9Q7P9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cdhr2E9Q7P9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cdhr2E9Q7P9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cdhr2E9Q7P9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cdhr2E9Q7P9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cdhr2E9Q7P9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cdhr2E9Q7P9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cdhr2E9Q7P9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Cdhr2E9Q7P9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cdhr2E9Q7P9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cdhr2E9Q7P9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cdhr2E9Q7P9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cdhr2E9Q7P9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cdhr2E9Q7P9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cdhr2E9Q7P9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cdhr2E9Q7P9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cdhr2E9Q7P9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Cdhr2E9Q7P9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cdhr2E9Q7P9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Cdhr2E9Q7P9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cdhr2E9Q7P9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cdhr2E9Q7P9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cdhr2E9Q7P9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cdhr2E9Q7P9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cdhr2E9Q7P9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cdhr2E9Q7P9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Cdhr2E9Q7P9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cdhr2E9Q7P9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cdhr2E9Q7P9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cdhr2E9Q7P9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cdhr2E9Q7P9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cdhr2E9Q7P9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cdhr2E9Q7P9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cdhr2E9Q7P9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cdhr2E9Q7P9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdhr2E9Q7P9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdhr2E9Q7P9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdhr2E9Q7P9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdhr2E9Q7P9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdhr2E9Q7P9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdhr2E9Q7P9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cdhr2E9Q7P9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cdhr2E9Q7P9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cdhr2E9Q7P9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cdhr2E9Q7P9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cdhr2E9Q7P9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cdhr2E9Q7P9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cdhr2E9Q7P9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cdhr2E9Q7P9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Cdhr2E9Q7P9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cdhr2E9Q7P9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cdhr2E9Q7P9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cdhr2E9Q7P9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cdhr2E9Q7P9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cdhr2E9Q7P9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cdhr2E9Q7P9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.9 ms