Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P2

Cacna1i, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1iE9Q7P2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1iE9Q7P2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1iE9Q7P2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1iE9Q7P2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cacna1iE9Q7P2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna1iE9Q7P2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms