Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Urb2E9Q7L1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Urb2E9Q7L1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Urb2E9Q7L1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Urb2E9Q7L1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Urb2E9Q7L1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Urb2E9Q7L1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
Urb2E9Q7L1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Urb2E9Q7L1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Urb2E9Q7L1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Urb2E9Q7L1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Urb2E9Q7L1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Urb2E9Q7L1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Urb2E9Q7L1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Urb2E9Q7L1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Urb2E9Q7L1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Urb2E9Q7L1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Urb2E9Q7L1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Urb2E9Q7L1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Urb2E9Q7L1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Urb2E9Q7L1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Urb2E9Q7L1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Urb2E9Q7L1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Urb2E9Q7L1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Urb2E9Q7L1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Urb2E9Q7L1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Urb2E9Q7L1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Urb2E9Q7L1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Urb2E9Q7L1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Urb2E9Q7L1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Urb2E9Q7L1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Urb2E9Q7L1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Urb2E9Q7L1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Urb2E9Q7L1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Urb2E9Q7L1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
Urb2E9Q7L1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Urb2E9Q7L1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Urb2E9Q7L1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Urb2E9Q7L1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Urb2E9Q7L1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Urb2E9Q7L1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
Urb2E9Q7L1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Urb2E9Q7L1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Urb2E9Q7L1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Urb2E9Q7L1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Urb2E9Q7L1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Urb2E9Q7L1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Urb2E9Q7L1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Urb2E9Q7L1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Urb2E9Q7L1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Urb2E9Q7L1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
Urb2E9Q7L1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Urb2E9Q7L1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Urb2E9Q7L1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Urb2E9Q7L1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Urb2E9Q7L1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Urb2E9Q7L1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
Urb2E9Q7L1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Urb2E9Q7L1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Urb2E9Q7L1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Urb2E9Q7L1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Urb2E9Q7L1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Urb2E9Q7L1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Urb2E9Q7L1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Urb2E9Q7L1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Urb2E9Q7L1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Urb2E9Q7L1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
Urb2E9Q7L1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Urb2E9Q7L1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Urb2E9Q7L1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Urb2E9Q7L1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Urb2E9Q7L1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Urb2E9Q7L1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Urb2E9Q7L1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Urb2E9Q7L1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Urb2E9Q7L1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Urb2E9Q7L1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
Urb2E9Q7L1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Urb2E9Q7L1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Urb2E9Q7L1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Urb2E9Q7L1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Urb2E9Q7L1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
Urb2E9Q7L1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Urb2E9Q7L1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Urb2E9Q7L1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
Urb2E9Q7L1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Urb2E9Q7L1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Urb2E9Q7L1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Urb2E9Q7L1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Urb2E9Q7L1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Urb2E9Q7L1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Urb2E9Q7L1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Urb2E9Q7L1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Urb2E9Q7L1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Urb2E9Q7L1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Urb2E9Q7L1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
Urb2E9Q7L1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Urb2E9Q7L1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Urb2E9Q7L1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Urb2E9Q7L1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms