Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Simc1E9Q6E9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Simc1E9Q6E9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Simc1E9Q6E9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Simc1E9Q6E9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Simc1E9Q6E9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Simc1E9Q6E9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Simc1E9Q6E9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Simc1E9Q6E9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Simc1E9Q6E9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Simc1E9Q6E9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Simc1E9Q6E9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Simc1E9Q6E9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Simc1E9Q6E9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Simc1E9Q6E9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Simc1E9Q6E9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Simc1E9Q6E9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Simc1E9Q6E9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Simc1E9Q6E9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Simc1E9Q6E9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Simc1E9Q6E9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Simc1E9Q6E9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Simc1E9Q6E9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Simc1E9Q6E9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Simc1E9Q6E9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Simc1E9Q6E9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Simc1E9Q6E9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Simc1E9Q6E9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Simc1E9Q6E9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Simc1E9Q6E9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Simc1E9Q6E9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Simc1E9Q6E9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Simc1E9Q6E9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Simc1E9Q6E9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Simc1E9Q6E9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Simc1E9Q6E9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Simc1E9Q6E9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Simc1E9Q6E9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Simc1E9Q6E9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Simc1E9Q6E9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Simc1E9Q6E9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Simc1E9Q6E9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Simc1E9Q6E9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Simc1E9Q6E9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Simc1E9Q6E9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Simc1E9Q6E9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Simc1E9Q6E9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Simc1E9Q6E9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Simc1E9Q6E9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Simc1E9Q6E9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Simc1E9Q6E9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Simc1E9Q6E9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Simc1E9Q6E9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Simc1E9Q6E9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Simc1E9Q6E9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Simc1E9Q6E9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Simc1E9Q6E9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Simc1E9Q6E9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Simc1E9Q6E9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Simc1E9Q6E9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Simc1E9Q6E9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Simc1E9Q6E9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Simc1E9Q6E9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Simc1E9Q6E9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Simc1E9Q6E9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Simc1E9Q6E9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Simc1E9Q6E9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Simc1E9Q6E9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Simc1E9Q6E9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Simc1E9Q6E9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Simc1E9Q6E9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Simc1E9Q6E9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Simc1E9Q6E9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Simc1E9Q6E9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Simc1E9Q6E9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Simc1E9Q6E9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Simc1E9Q6E9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Simc1E9Q6E9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Simc1E9Q6E9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Simc1E9Q6E9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Simc1E9Q6E9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Simc1E9Q6E9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Simc1E9Q6E9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Simc1E9Q6E9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Simc1E9Q6E9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Simc1E9Q6E9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Simc1E9Q6E9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Simc1E9Q6E9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Simc1E9Q6E9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Simc1E9Q6E9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Simc1E9Q6E9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Simc1E9Q6E9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Simc1E9Q6E9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Simc1E9Q6E9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Simc1E9Q6E9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Simc1E9Q6E9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Simc1E9Q6E9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Simc1E9Q6E9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Simc1E9Q6E9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Simc1E9Q6E9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms