Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5M4

Zfr2, Zinc finger RNA-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfr2E9Q5M4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zfr2E9Q5M4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zfr2E9Q5M4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zfr2E9Q5M4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfr2E9Q5M4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfr2E9Q5M4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfr2E9Q5M4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfr2E9Q5M4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfr2E9Q5M4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfr2E9Q5M4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfr2E9Q5M4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfr2E9Q5M4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfr2E9Q5M4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfr2E9Q5M4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfr2E9Q5M4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfr2E9Q5M4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfr2E9Q5M4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfr2E9Q5M4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfr2E9Q5M4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfr2E9Q5M4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfr2E9Q5M4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfr2E9Q5M4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfr2E9Q5M4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfr2E9Q5M4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfr2E9Q5M4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfr2E9Q5M4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfr2E9Q5M4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfr2E9Q5M4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfr2E9Q5M4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfr2E9Q5M4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfr2E9Q5M4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfr2E9Q5M4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfr2E9Q5M4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfr2E9Q5M4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfr2E9Q5M4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfr2E9Q5M4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfr2E9Q5M4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfr2E9Q5M4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfr2E9Q5M4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfr2E9Q5M4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfr2E9Q5M4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfr2E9Q5M4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfr2E9Q5M4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfr2E9Q5M4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfr2E9Q5M4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfr2E9Q5M4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfr2E9Q5M4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfr2E9Q5M4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfr2E9Q5M4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfr2E9Q5M4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zfr2E9Q5M4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfr2E9Q5M4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfr2E9Q5M4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfr2E9Q5M4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfr2E9Q5M4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfr2E9Q5M4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfr2E9Q5M4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfr2E9Q5M4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfr2E9Q5M4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfr2E9Q5M4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfr2E9Q5M4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfr2E9Q5M4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfr2E9Q5M4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfr2E9Q5M4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfr2E9Q5M4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfr2E9Q5M4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfr2E9Q5M4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfr2E9Q5M4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfr2E9Q5M4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfr2E9Q5M4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfr2E9Q5M4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfr2E9Q5M4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfr2E9Q5M4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfr2E9Q5M4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfr2E9Q5M4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfr2E9Q5M4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfr2E9Q5M4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfr2E9Q5M4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfr2E9Q5M4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfr2E9Q5M4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfr2E9Q5M4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfr2E9Q5M4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfr2E9Q5M4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfr2E9Q5M4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfr2E9Q5M4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfr2E9Q5M4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfr2E9Q5M4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfr2E9Q5M4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfr2E9Q5M4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfr2E9Q5M4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfr2E9Q5M4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfr2E9Q5M4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfr2E9Q5M4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfr2E9Q5M4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfr2E9Q5M4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfr2E9Q5M4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zfr2E9Q5M4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zfr2E9Q5M4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zfr2E9Q5M4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Zfr2E9Q5M4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms