Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20518E9Q548 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20518E9Q548 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20518E9Q548 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20518E9Q548 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20518E9Q548 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20518E9Q548 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20518E9Q548 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20518E9Q548 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20518E9Q548 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20518E9Q548 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20518E9Q548 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20518E9Q548 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20518E9Q548 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20518E9Q548 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20518E9Q548 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20518E9Q548 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20518E9Q548 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20518E9Q548 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20518E9Q548 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20518E9Q548 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20518E9Q548 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20518E9Q548 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20518E9Q548 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20518E9Q548 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20518E9Q548 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20518E9Q548 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20518E9Q548 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20518E9Q548 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20518E9Q548 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20518E9Q548 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20518E9Q548 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20518E9Q548 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20518E9Q548 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20518E9Q548 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm20518E9Q548 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm20518E9Q548 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm20518E9Q548 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm20518E9Q548 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm20518E9Q548 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm20518E9Q548 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm20518E9Q548 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm20518E9Q548 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm20518E9Q548 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm20518E9Q548 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm20518E9Q548 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm20518E9Q548 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm20518E9Q548 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm20518E9Q548 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm20518E9Q548 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20518E9Q548 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20518E9Q548 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20518E9Q548 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20518E9Q548 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20518E9Q548 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20518E9Q548 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20518E9Q548 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20518E9Q548 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20518E9Q548 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm20518E9Q548 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm20518E9Q548 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm20518E9Q548 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm20518E9Q548 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm20518E9Q548 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm20518E9Q548 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm20518E9Q548 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm20518E9Q548 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm20518E9Q548 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20518E9Q548 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20518E9Q548 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20518E9Q548 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20518E9Q548 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20518E9Q548 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20518E9Q548 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20518E9Q548 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20518E9Q548 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20518E9Q548 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20518E9Q548 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20518E9Q548 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20518E9Q548 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20518E9Q548 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm20518E9Q548 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm20518E9Q548 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm20518E9Q548 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm20518E9Q548 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm20518E9Q548 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm20518E9Q548 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm20518E9Q548 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm20518E9Q548 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm20518E9Q548 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm20518E9Q548 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm20518E9Q548 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm20518E9Q548 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms