Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1Z0

Krt90, Keratin 90, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt90E9Q1Z0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krt90E9Q1Z0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krt90E9Q1Z0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Krt90E9Q1Z0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Krt90E9Q1Z0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt90E9Q1Z0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt90E9Q1Z0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt90E9Q1Z0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krt90E9Q1Z0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt90E9Q1Z0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt90E9Q1Z0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt90E9Q1Z0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krt90E9Q1Z0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt90E9Q1Z0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt90E9Q1Z0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt90E9Q1Z0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt90E9Q1Z0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Krt90E9Q1Z0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt90E9Q1Z0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt90E9Q1Z0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt90E9Q1Z0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt90E9Q1Z0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt90E9Q1Z0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt90E9Q1Z0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt90E9Q1Z0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt90E9Q1Z0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt90E9Q1Z0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt90E9Q1Z0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt90E9Q1Z0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt90E9Q1Z0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt90E9Q1Z0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt90E9Q1Z0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt90E9Q1Z0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt90E9Q1Z0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt90E9Q1Z0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt90E9Q1Z0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt90E9Q1Z0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt90E9Q1Z0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt90E9Q1Z0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt90E9Q1Z0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt90E9Q1Z0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt90E9Q1Z0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt90E9Q1Z0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt90E9Q1Z0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt90E9Q1Z0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Krt90E9Q1Z0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Krt90E9Q1Z0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt90E9Q1Z0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt90E9Q1Z0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt90E9Q1Z0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt90E9Q1Z0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt90E9Q1Z0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt90E9Q1Z0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt90E9Q1Z0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt90E9Q1Z0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt90E9Q1Z0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt90E9Q1Z0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt90E9Q1Z0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt90E9Q1Z0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt90E9Q1Z0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt90E9Q1Z0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt90E9Q1Z0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt90E9Q1Z0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt90E9Q1Z0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt90E9Q1Z0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt90E9Q1Z0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt90E9Q1Z0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt90E9Q1Z0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt90E9Q1Z0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt90E9Q1Z0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt90E9Q1Z0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt90E9Q1Z0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt90E9Q1Z0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt90E9Q1Z0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt90E9Q1Z0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt90E9Q1Z0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt90E9Q1Z0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt90E9Q1Z0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt90E9Q1Z0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt90E9Q1Z0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt90E9Q1Z0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt90E9Q1Z0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt90E9Q1Z0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt90E9Q1Z0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt90E9Q1Z0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt90E9Q1Z0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt90E9Q1Z0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt90E9Q1Z0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt90E9Q1Z0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt90E9Q1Z0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt90E9Q1Z0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt90E9Q1Z0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt90E9Q1Z0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt90E9Q1Z0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt90E9Q1Z0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt90E9Q1Z0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt90E9Q1Z0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt90E9Q1Z0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt90E9Q1Z0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt90E9Q1Z0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms