Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.9 ms