Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrp3E9Q1T6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrp3E9Q1T6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrp3E9Q1T6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms