Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5415E9PXF3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5415E9PXF3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5415E9PXF3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5415E9PXF3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5415E9PXF3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5415E9PXF3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5415E9PXF3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5415E9PXF3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm5415E9PXF3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm5415E9PXF3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm5415E9PXF3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm5415E9PXF3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5415E9PXF3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5415E9PXF3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5415E9PXF3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5415E9PXF3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5415E9PXF3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5415E9PXF3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5415E9PXF3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5415E9PXF3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5415E9PXF3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5415E9PXF3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5415E9PXF3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5415E9PXF3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5415E9PXF3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5415E9PXF3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5415E9PXF3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5415E9PXF3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5415E9PXF3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5415E9PXF3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5415E9PXF3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5415E9PXF3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5415E9PXF3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5415E9PXF3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5415E9PXF3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5415E9PXF3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5415E9PXF3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5415E9PXF3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5415E9PXF3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5415E9PXF3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5415E9PXF3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5415E9PXF3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5415E9PXF3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5415E9PXF3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5415E9PXF3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5415E9PXF3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5415E9PXF3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5415E9PXF3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5415E9PXF3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5415E9PXF3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm5415E9PXF3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5415E9PXF3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5415E9PXF3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5415E9PXF3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5415E9PXF3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm5415E9PXF3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm5415E9PXF3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5415E9PXF3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5415E9PXF3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5415E9PXF3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm5415E9PXF3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5415E9PXF3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5415E9PXF3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5415E9PXF3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5415E9PXF3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5415E9PXF3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm5415E9PXF3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5415E9PXF3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5415E9PXF3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5415E9PXF3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5415E9PXF3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5415E9PXF3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5415E9PXF3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5415E9PXF3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5415E9PXF3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5415E9PXF3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5415E9PXF3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm5415E9PXF3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5415E9PXF3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5415E9PXF3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5415E9PXF3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5415E9PXF3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5415E9PXF3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5415E9PXF3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm5415E9PXF3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5415E9PXF3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5415E9PXF3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5415E9PXF3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5415E9PXF3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5415E9PXF3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5415E9PXF3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5415E9PXF3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm5415E9PXF3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5415E9PXF3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5415E9PXF3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5415E9PXF3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5415E9PXF3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5415E9PXF3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm5415E9PXF3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms