Protein–RNA interactions for Protein: E9PWI3

Mcc, Mutated in colorectal cancers, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MccE9PWI3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MccE9PWI3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MccE9PWI3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MccE9PWI3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MccE9PWI3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MccE9PWI3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MccE9PWI3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MccE9PWI3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MccE9PWI3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MccE9PWI3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MccE9PWI3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MccE9PWI3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MccE9PWI3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MccE9PWI3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MccE9PWI3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MccE9PWI3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MccE9PWI3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MccE9PWI3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MccE9PWI3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MccE9PWI3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
MccE9PWI3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MccE9PWI3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MccE9PWI3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MccE9PWI3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MccE9PWI3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MccE9PWI3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MccE9PWI3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MccE9PWI3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MccE9PWI3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MccE9PWI3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MccE9PWI3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MccE9PWI3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
MccE9PWI3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MccE9PWI3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MccE9PWI3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MccE9PWI3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
MccE9PWI3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MccE9PWI3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MccE9PWI3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MccE9PWI3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MccE9PWI3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MccE9PWI3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MccE9PWI3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MccE9PWI3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MccE9PWI3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MccE9PWI3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MccE9PWI3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MccE9PWI3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MccE9PWI3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MccE9PWI3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MccE9PWI3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MccE9PWI3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MccE9PWI3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MccE9PWI3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MccE9PWI3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MccE9PWI3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MccE9PWI3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MccE9PWI3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MccE9PWI3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MccE9PWI3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MccE9PWI3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MccE9PWI3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MccE9PWI3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MccE9PWI3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MccE9PWI3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
MccE9PWI3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MccE9PWI3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MccE9PWI3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MccE9PWI3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MccE9PWI3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MccE9PWI3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MccE9PWI3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MccE9PWI3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MccE9PWI3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MccE9PWI3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MccE9PWI3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MccE9PWI3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MccE9PWI3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MccE9PWI3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MccE9PWI3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MccE9PWI3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MccE9PWI3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MccE9PWI3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
MccE9PWI3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MccE9PWI3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MccE9PWI3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MccE9PWI3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MccE9PWI3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MccE9PWI3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
MccE9PWI3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MccE9PWI3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MccE9PWI3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MccE9PWI3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MccE9PWI3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MccE9PWI3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MccE9PWI3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MccE9PWI3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MccE9PWI3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MccE9PWI3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MccE9PWI3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms