Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc13D3YV10 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc13D3YV10 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc13D3YV10 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc13D3YV10 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc13D3YV10 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc13D3YV10 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc13D3YV10 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc13D3YV10 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc13D3YV10 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc13D3YV10 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc13D3YV10 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc13D3YV10 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc13D3YV10 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc13D3YV10 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc13D3YV10 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc13D3YV10 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc13D3YV10 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc13D3YV10 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc13D3YV10 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc13D3YV10 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc13D3YV10 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc13D3YV10 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc13D3YV10 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc13D3YV10 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc13D3YV10 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc13D3YV10 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc13D3YV10 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc13D3YV10 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc13D3YV10 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc13D3YV10 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc13D3YV10 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc13D3YV10 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc13D3YV10 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc13D3YV10 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc13D3YV10 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc13D3YV10 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc13D3YV10 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc13D3YV10 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc13D3YV10 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc13D3YV10 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc13D3YV10 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc13D3YV10 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc13D3YV10 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc13D3YV10 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc13D3YV10 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc13D3YV10 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc13D3YV10 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc13D3YV10 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc13D3YV10 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc13D3YV10 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc13D3YV10 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc13D3YV10 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc13D3YV10 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc13D3YV10 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc13D3YV10 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc13D3YV10 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc13D3YV10 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc13D3YV10 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc13D3YV10 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc13D3YV10 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc13D3YV10 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc13D3YV10 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc13D3YV10 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc13D3YV10 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc13D3YV10 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc13D3YV10 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc13D3YV10 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc13D3YV10 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc13D3YV10 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc13D3YV10 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc13D3YV10 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc13D3YV10 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc13D3YV10 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc13D3YV10 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc13D3YV10 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc13D3YV10 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc13D3YV10 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc13D3YV10 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc13D3YV10 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc13D3YV10 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc13D3YV10 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc13D3YV10 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc13D3YV10 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc13D3YV10 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc13D3YV10 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc13D3YV10 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc13D3YV10 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc13D3YV10 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc13D3YV10 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc13D3YV10 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc13D3YV10 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc13D3YV10 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc13D3YV10 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc13D3YV10 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc13D3YV10 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc13D3YV10 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc13D3YV10 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc13D3YV10 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc13D3YV10 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms