Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlrc5C3VPR6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlrc5C3VPR6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlrc5C3VPR6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlrc5C3VPR6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlrc5C3VPR6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlrc5C3VPR6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlrc5C3VPR6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlrc5C3VPR6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nlrc5C3VPR6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Nlrc5C3VPR6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nlrc5C3VPR6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nlrc5C3VPR6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nlrc5C3VPR6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nlrc5C3VPR6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nlrc5C3VPR6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlrc5C3VPR6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlrc5C3VPR6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlrc5C3VPR6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nlrc5C3VPR6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nlrc5C3VPR6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nlrc5C3VPR6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nlrc5C3VPR6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nlrc5C3VPR6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nlrc5C3VPR6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlrc5C3VPR6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlrc5C3VPR6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlrc5C3VPR6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlrc5C3VPR6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlrc5C3VPR6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlrc5C3VPR6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlrc5C3VPR6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlrc5C3VPR6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlrc5C3VPR6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlrc5C3VPR6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlrc5C3VPR6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlrc5C3VPR6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlrc5C3VPR6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlrc5C3VPR6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nlrc5C3VPR6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nlrc5C3VPR6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nlrc5C3VPR6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nlrc5C3VPR6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nlrc5C3VPR6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nlrc5C3VPR6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nlrc5C3VPR6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlrc5C3VPR6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlrc5C3VPR6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlrc5C3VPR6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlrc5C3VPR6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrc5C3VPR6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrc5C3VPR6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrc5C3VPR6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nlrc5C3VPR6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nlrc5C3VPR6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nlrc5C3VPR6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nlrc5C3VPR6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nlrc5C3VPR6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Nlrc5C3VPR6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nlrc5C3VPR6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nlrc5C3VPR6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Nlrc5C3VPR6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nlrc5C3VPR6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nlrc5C3VPR6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nlrc5C3VPR6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nlrc5C3VPR6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nlrc5C3VPR6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nlrc5C3VPR6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Nlrc5C3VPR6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nlrc5C3VPR6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlrc5C3VPR6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlrc5C3VPR6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlrc5C3VPR6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlrc5C3VPR6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrc5C3VPR6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrc5C3VPR6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrc5C3VPR6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlrc5C3VPR6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlrc5C3VPR6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlrc5C3VPR6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlrc5C3VPR6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlrc5C3VPR6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlrc5C3VPR6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlrc5C3VPR6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlrc5C3VPR6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlrc5C3VPR6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlrc5C3VPR6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlrc5C3VPR6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlrc5C3VPR6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlrc5C3VPR6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlrc5C3VPR6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlrc5C3VPR6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlrc5C3VPR6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlrc5C3VPR6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlrc5C3VPR6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlrc5C3VPR6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlrc5C3VPR6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlrc5C3VPR6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlrc5C3VPR6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nlrc5C3VPR6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms