Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ptprz1B9EKR1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ptprz1B9EKR1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ptprz1B9EKR1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ptprz1B9EKR1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ptprz1B9EKR1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ptprz1B9EKR1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ptprz1B9EKR1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ptprz1B9EKR1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ptprz1B9EKR1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ptprz1B9EKR1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ptprz1B9EKR1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ptprz1B9EKR1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ptprz1B9EKR1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ptprz1B9EKR1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ptprz1B9EKR1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ptprz1B9EKR1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Ptprz1B9EKR1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ptprz1B9EKR1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ptprz1B9EKR1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ptprz1B9EKR1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ptprz1B9EKR1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ptprz1B9EKR1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ptprz1B9EKR1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ptprz1B9EKR1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ptprz1B9EKR1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ptprz1B9EKR1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ptprz1B9EKR1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ptprz1B9EKR1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ptprz1B9EKR1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ptprz1B9EKR1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ptprz1B9EKR1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ptprz1B9EKR1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ptprz1B9EKR1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ptprz1B9EKR1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ptprz1B9EKR1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ptprz1B9EKR1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ptprz1B9EKR1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ptprz1B9EKR1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ptprz1B9EKR1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ptprz1B9EKR1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ptprz1B9EKR1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ptprz1B9EKR1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ptprz1B9EKR1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ptprz1B9EKR1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ptprz1B9EKR1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ptprz1B9EKR1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ptprz1B9EKR1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ptprz1B9EKR1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ptprz1B9EKR1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ptprz1B9EKR1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ptprz1B9EKR1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ptprz1B9EKR1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ptprz1B9EKR1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ptprz1B9EKR1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ptprz1B9EKR1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ptprz1B9EKR1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ptprz1B9EKR1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ptprz1B9EKR1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ptprz1B9EKR1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ptprz1B9EKR1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ptprz1B9EKR1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ptprz1B9EKR1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ptprz1B9EKR1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ptprz1B9EKR1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ptprz1B9EKR1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ptprz1B9EKR1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ptprz1B9EKR1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ptprz1B9EKR1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ptprz1B9EKR1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ptprz1B9EKR1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ptprz1B9EKR1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ptprz1B9EKR1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ptprz1B9EKR1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ptprz1B9EKR1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ptprz1B9EKR1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ptprz1B9EKR1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ptprz1B9EKR1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ptprz1B9EKR1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ptprz1B9EKR1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ptprz1B9EKR1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ptprz1B9EKR1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ptprz1B9EKR1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ptprz1B9EKR1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ptprz1B9EKR1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ptprz1B9EKR1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ptprz1B9EKR1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ptprz1B9EKR1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ptprz1B9EKR1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ptprz1B9EKR1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
Ptprz1B9EKR1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ptprz1B9EKR1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.1 ms