Protein–RNA interactions for Protein: B9EK86

Vmn1r180, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r180B9EK86 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r180B9EK86 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r180B9EK86 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r180B9EK86 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r180B9EK86 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r180B9EK86 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms