Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mterf1bB9EJ57 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mterf1bB9EJ57 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Mterf1bB9EJ57 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mterf1bB9EJ57 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Mterf1bB9EJ57 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mterf1bB9EJ57 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mterf1bB9EJ57 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mterf1bB9EJ57 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mterf1bB9EJ57 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mterf1bB9EJ57 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mterf1bB9EJ57 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mterf1bB9EJ57 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mterf1bB9EJ57 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mterf1bB9EJ57 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Mterf1bB9EJ57 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mterf1bB9EJ57 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mterf1bB9EJ57 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Mterf1bB9EJ57 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Mterf1bB9EJ57 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mterf1bB9EJ57 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mterf1bB9EJ57 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mterf1bB9EJ57 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mterf1bB9EJ57 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mterf1bB9EJ57 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mterf1bB9EJ57 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mterf1bB9EJ57 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mterf1bB9EJ57 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mterf1bB9EJ57 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mterf1bB9EJ57 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mterf1bB9EJ57 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mterf1bB9EJ57 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mterf1bB9EJ57 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mterf1bB9EJ57 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mterf1bB9EJ57 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mterf1bB9EJ57 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mterf1bB9EJ57 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mterf1bB9EJ57 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Mterf1bB9EJ57 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mterf1bB9EJ57 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Mterf1bB9EJ57 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Mterf1bB9EJ57 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Mterf1bB9EJ57 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mterf1bB9EJ57 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mterf1bB9EJ57 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mterf1bB9EJ57 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mterf1bB9EJ57 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mterf1bB9EJ57 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mterf1bB9EJ57 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mterf1bB9EJ57 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mterf1bB9EJ57 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mterf1bB9EJ57 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mterf1bB9EJ57 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mterf1bB9EJ57 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mterf1bB9EJ57 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mterf1bB9EJ57 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mterf1bB9EJ57 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mterf1bB9EJ57 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mterf1bB9EJ57 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mterf1bB9EJ57 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mterf1bB9EJ57 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mterf1bB9EJ57 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mterf1bB9EJ57 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mterf1bB9EJ57 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mterf1bB9EJ57 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mterf1bB9EJ57 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mterf1bB9EJ57 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mterf1bB9EJ57 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mterf1bB9EJ57 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mterf1bB9EJ57 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mterf1bB9EJ57 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mterf1bB9EJ57 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mterf1bB9EJ57 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mterf1bB9EJ57 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mterf1bB9EJ57 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mterf1bB9EJ57 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mterf1bB9EJ57 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mterf1bB9EJ57 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mterf1bB9EJ57 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mterf1bB9EJ57 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mterf1bB9EJ57 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mterf1bB9EJ57 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mterf1bB9EJ57 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mterf1bB9EJ57 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mterf1bB9EJ57 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mterf1bB9EJ57 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Mterf1bB9EJ57 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mterf1bB9EJ57 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mterf1bB9EJ57 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mterf1bB9EJ57 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mterf1bB9EJ57 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mterf1bB9EJ57 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mterf1bB9EJ57 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Mterf1bB9EJ57 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mterf1bB9EJ57 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mterf1bB9EJ57 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mterf1bB9EJ57 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mterf1bB9EJ57 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mterf1bB9EJ57 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mterf1bB9EJ57 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms