Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Otud4B2RRE7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otud4B2RRE7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otud4B2RRE7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otud4B2RRE7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Otud4B2RRE7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otud4B2RRE7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otud4B2RRE7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otud4B2RRE7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Otud4B2RRE7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Otud4B2RRE7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Otud4B2RRE7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Otud4B2RRE7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Otud4B2RRE7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Otud4B2RRE7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Otud4B2RRE7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Otud4B2RRE7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Otud4B2RRE7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Otud4B2RRE7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Otud4B2RRE7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Otud4B2RRE7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Otud4B2RRE7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Otud4B2RRE7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Otud4B2RRE7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Otud4B2RRE7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Otud4B2RRE7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Otud4B2RRE7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Otud4B2RRE7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Otud4B2RRE7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Otud4B2RRE7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Otud4B2RRE7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Otud4B2RRE7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Otud4B2RRE7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Otud4B2RRE7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Otud4B2RRE7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Otud4B2RRE7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Otud4B2RRE7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Otud4B2RRE7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Otud4B2RRE7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otud4B2RRE7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otud4B2RRE7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otud4B2RRE7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otud4B2RRE7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otud4B2RRE7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otud4B2RRE7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otud4B2RRE7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otud4B2RRE7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otud4B2RRE7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otud4B2RRE7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otud4B2RRE7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Otud4B2RRE7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Otud4B2RRE7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Otud4B2RRE7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms