Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp42B2RQC2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp42B2RQC2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp42B2RQC2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp42B2RQC2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp42B2RQC2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp42B2RQC2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp42B2RQC2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp42B2RQC2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp42B2RQC2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp42B2RQC2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp42B2RQC2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp42B2RQC2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp42B2RQC2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp42B2RQC2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp42B2RQC2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp42B2RQC2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp42B2RQC2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp42B2RQC2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp42B2RQC2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp42B2RQC2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Usp42B2RQC2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp42B2RQC2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp42B2RQC2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp42B2RQC2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp42B2RQC2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp42B2RQC2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp42B2RQC2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp42B2RQC2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp42B2RQC2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp42B2RQC2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp42B2RQC2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp42B2RQC2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp42B2RQC2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp42B2RQC2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp42B2RQC2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp42B2RQC2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp42B2RQC2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp42B2RQC2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp42B2RQC2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp42B2RQC2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp42B2RQC2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp42B2RQC2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp42B2RQC2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp42B2RQC2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp42B2RQC2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp42B2RQC2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp42B2RQC2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp42B2RQC2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp42B2RQC2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp42B2RQC2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp42B2RQC2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp42B2RQC2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp42B2RQC2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp42B2RQC2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp42B2RQC2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp42B2RQC2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp42B2RQC2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp42B2RQC2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp42B2RQC2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp42B2RQC2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp42B2RQC2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp42B2RQC2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp42B2RQC2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp42B2RQC2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp42B2RQC2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp42B2RQC2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp42B2RQC2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp42B2RQC2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp42B2RQC2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp42B2RQC2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp42B2RQC2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp42B2RQC2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp42B2RQC2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp42B2RQC2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp42B2RQC2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp42B2RQC2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp42B2RQC2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp42B2RQC2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp42B2RQC2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp42B2RQC2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp42B2RQC2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp42B2RQC2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp42B2RQC2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp42B2RQC2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp42B2RQC2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp42B2RQC2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp42B2RQC2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp42B2RQC2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp42B2RQC2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Usp42B2RQC2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp42B2RQC2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp42B2RQC2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp42B2RQC2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp42B2RQC2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp42B2RQC2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp42B2RQC2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp42B2RQC2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp42B2RQC2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp42B2RQC2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms