Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Scn7aB1AYL1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Scn7aB1AYL1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Scn7aB1AYL1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Scn7aB1AYL1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Scn7aB1AYL1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Scn7aB1AYL1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Scn7aB1AYL1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Scn7aB1AYL1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Scn7aB1AYL1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Scn7aB1AYL1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Scn7aB1AYL1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Scn7aB1AYL1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Scn7aB1AYL1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Scn7aB1AYL1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Scn7aB1AYL1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Scn7aB1AYL1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Scn7aB1AYL1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Scn7aB1AYL1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Scn7aB1AYL1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Scn7aB1AYL1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Scn7aB1AYL1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Scn7aB1AYL1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Scn7aB1AYL1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Scn7aB1AYL1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Scn7aB1AYL1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Scn7aB1AYL1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Scn7aB1AYL1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Scn7aB1AYL1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Scn7aB1AYL1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Scn7aB1AYL1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Scn7aB1AYL1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Scn7aB1AYL1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Scn7aB1AYL1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Scn7aB1AYL1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Scn7aB1AYL1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Scn7aB1AYL1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Scn7aB1AYL1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Scn7aB1AYL1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Scn7aB1AYL1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Scn7aB1AYL1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Scn7aB1AYL1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Scn7aB1AYL1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Scn7aB1AYL1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Scn7aB1AYL1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Scn7aB1AYL1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Scn7aB1AYL1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Scn7aB1AYL1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Scn7aB1AYL1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Scn7aB1AYL1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Scn7aB1AYL1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Scn7aB1AYL1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Scn7aB1AYL1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Scn7aB1AYL1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Scn7aB1AYL1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Scn7aB1AYL1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Scn7aB1AYL1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Scn7aB1AYL1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Scn7aB1AYL1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Scn7aB1AYL1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Scn7aB1AYL1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Scn7aB1AYL1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Scn7aB1AYL1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Scn7aB1AYL1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Scn7aB1AYL1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Scn7aB1AYL1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Scn7aB1AYL1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Scn7aB1AYL1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Scn7aB1AYL1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Scn7aB1AYL1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Scn7aB1AYL1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Scn7aB1AYL1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Scn7aB1AYL1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Scn7aB1AYL1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Scn7aB1AYL1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Scn7aB1AYL1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Scn7aB1AYL1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Scn7aB1AYL1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Scn7aB1AYL1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Scn7aB1AYL1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Scn7aB1AYL1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Scn7aB1AYL1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Scn7aB1AYL1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Scn7aB1AYL1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Scn7aB1AYL1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Scn7aB1AYL1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Scn7aB1AYL1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Scn7aB1AYL1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Scn7aB1AYL1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Scn7aB1AYL1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Scn7aB1AYL1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Scn7aB1AYL1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Scn7aB1AYL1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Scn7aB1AYL1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Scn7aB1AYL1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Scn7aB1AYL1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Scn7aB1AYL1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Scn7aB1AYL1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Scn7aB1AYL1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Scn7aB1AYL1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms