Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem238A9JSM3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem238A9JSM3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem238A9JSM3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem238A9JSM3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem238A9JSM3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem238A9JSM3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem238A9JSM3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem238A9JSM3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem238A9JSM3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem238A9JSM3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem238A9JSM3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem238A9JSM3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem238A9JSM3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem238A9JSM3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem238A9JSM3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem238A9JSM3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem238A9JSM3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem238A9JSM3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem238A9JSM3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem238A9JSM3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem238A9JSM3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem238A9JSM3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem238A9JSM3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem238A9JSM3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem238A9JSM3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem238A9JSM3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem238A9JSM3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem238A9JSM3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem238A9JSM3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem238A9JSM3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem238A9JSM3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem238A9JSM3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem238A9JSM3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem238A9JSM3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.2 ms