Protein–RNA interactions for Protein: A3KMP2

Ttc38, Tetratricopeptide repeat protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc38A3KMP2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttc38A3KMP2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttc38A3KMP2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttc38A3KMP2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttc38A3KMP2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttc38A3KMP2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttc38A3KMP2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ttc38A3KMP2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ttc38A3KMP2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ttc38A3KMP2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ttc38A3KMP2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ttc38A3KMP2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ttc38A3KMP2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ttc38A3KMP2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ttc38A3KMP2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttc38A3KMP2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttc38A3KMP2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttc38A3KMP2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttc38A3KMP2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttc38A3KMP2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttc38A3KMP2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttc38A3KMP2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttc38A3KMP2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttc38A3KMP2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttc38A3KMP2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttc38A3KMP2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttc38A3KMP2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttc38A3KMP2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttc38A3KMP2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttc38A3KMP2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttc38A3KMP2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttc38A3KMP2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ttc38A3KMP2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc38A3KMP2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc38A3KMP2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc38A3KMP2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc38A3KMP2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc38A3KMP2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc38A3KMP2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc38A3KMP2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc38A3KMP2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc38A3KMP2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc38A3KMP2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc38A3KMP2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc38A3KMP2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc38A3KMP2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc38A3KMP2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttc38A3KMP2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc38A3KMP2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc38A3KMP2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc38A3KMP2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc38A3KMP2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc38A3KMP2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc38A3KMP2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc38A3KMP2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttc38A3KMP2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc38A3KMP2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc38A3KMP2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc38A3KMP2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttc38A3KMP2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc38A3KMP2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc38A3KMP2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc38A3KMP2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttc38A3KMP2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc38A3KMP2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc38A3KMP2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc38A3KMP2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc38A3KMP2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc38A3KMP2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc38A3KMP2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc38A3KMP2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc38A3KMP2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttc38A3KMP2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc38A3KMP2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttc38A3KMP2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ttc38A3KMP2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ttc38A3KMP2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc38A3KMP2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc38A3KMP2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttc38A3KMP2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc38A3KMP2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc38A3KMP2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc38A3KMP2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc38A3KMP2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttc38A3KMP2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc38A3KMP2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc38A3KMP2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc38A3KMP2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc38A3KMP2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc38A3KMP2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc38A3KMP2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc38A3KMP2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc38A3KMP2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc38A3KMP2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc38A3KMP2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc38A3KMP2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttc38A3KMP2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc38A3KMP2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc38A3KMP2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttc38A3KMP2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
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