Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Odf2A3KGV1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Odf2A3KGV1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Odf2A3KGV1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Odf2A3KGV1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Odf2A3KGV1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Odf2A3KGV1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Odf2A3KGV1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Odf2A3KGV1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Odf2A3KGV1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Odf2A3KGV1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Odf2A3KGV1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Odf2A3KGV1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Odf2A3KGV1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Odf2A3KGV1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Odf2A3KGV1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Odf2A3KGV1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Odf2A3KGV1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Odf2A3KGV1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Odf2A3KGV1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Odf2A3KGV1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Odf2A3KGV1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Odf2A3KGV1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Odf2A3KGV1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Odf2A3KGV1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Odf2A3KGV1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Odf2A3KGV1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Odf2A3KGV1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Odf2A3KGV1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Odf2A3KGV1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Odf2A3KGV1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Odf2A3KGV1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Odf2A3KGV1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Odf2A3KGV1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Odf2A3KGV1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Odf2A3KGV1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Odf2A3KGV1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Odf2A3KGV1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Odf2A3KGV1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Odf2A3KGV1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Odf2A3KGV1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Odf2A3KGV1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Odf2A3KGV1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Odf2A3KGV1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Odf2A3KGV1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Odf2A3KGV1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Odf2A3KGV1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Odf2A3KGV1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Odf2A3KGV1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Odf2A3KGV1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Odf2A3KGV1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Odf2A3KGV1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Odf2A3KGV1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Odf2A3KGV1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Odf2A3KGV1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Odf2A3KGV1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Odf2A3KGV1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Odf2A3KGV1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Odf2A3KGV1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Odf2A3KGV1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Odf2A3KGV1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Odf2A3KGV1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Odf2A3KGV1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Odf2A3KGV1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Odf2A3KGV1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Odf2A3KGV1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Odf2A3KGV1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Odf2A3KGV1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Odf2A3KGV1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Odf2A3KGV1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Odf2A3KGV1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Odf2A3KGV1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Odf2A3KGV1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Odf2A3KGV1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Odf2A3KGV1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Odf2A3KGV1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Odf2A3KGV1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Odf2A3KGV1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Odf2A3KGV1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Odf2A3KGV1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Odf2A3KGV1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Odf2A3KGV1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Odf2A3KGV1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Odf2A3KGV1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Odf2A3KGV1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Odf2A3KGV1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Odf2A3KGV1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Odf2A3KGV1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Odf2A3KGV1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Odf2A3KGV1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Odf2A3KGV1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Odf2A3KGV1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Odf2A3KGV1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Odf2A3KGV1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Odf2A3KGV1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Odf2A3KGV1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Odf2A3KGV1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Odf2A3KGV1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Odf2A3KGV1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Odf2A3KGV1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms