Protein–RNA interactions for Protein: A2VDH3

Lrrc38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc38A2VDH3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc38A2VDH3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc38A2VDH3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc38A2VDH3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc38A2VDH3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc38A2VDH3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc38A2VDH3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc38A2VDH3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc38A2VDH3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc38A2VDH3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc38A2VDH3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc38A2VDH3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc38A2VDH3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc38A2VDH3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc38A2VDH3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc38A2VDH3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc38A2VDH3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc38A2VDH3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc38A2VDH3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrc38A2VDH3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrc38A2VDH3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrc38A2VDH3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrc38A2VDH3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrc38A2VDH3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrc38A2VDH3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrc38A2VDH3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrc38A2VDH3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrc38A2VDH3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrc38A2VDH3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrc38A2VDH3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrc38A2VDH3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrc38A2VDH3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrc38A2VDH3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrc38A2VDH3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrc38A2VDH3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrc38A2VDH3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lrrc38A2VDH3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrc38A2VDH3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrc38A2VDH3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrc38A2VDH3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrc38A2VDH3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrc38A2VDH3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrc38A2VDH3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrc38A2VDH3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc38A2VDH3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc38A2VDH3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc38A2VDH3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc38A2VDH3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc38A2VDH3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc38A2VDH3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc38A2VDH3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc38A2VDH3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc38A2VDH3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc38A2VDH3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc38A2VDH3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc38A2VDH3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc38A2VDH3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc38A2VDH3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc38A2VDH3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc38A2VDH3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc38A2VDH3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc38A2VDH3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc38A2VDH3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc38A2VDH3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc38A2VDH3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc38A2VDH3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc38A2VDH3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc38A2VDH3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc38A2VDH3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc38A2VDH3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc38A2VDH3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc38A2VDH3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc38A2VDH3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc38A2VDH3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc38A2VDH3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc38A2VDH3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc38A2VDH3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc38A2VDH3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc38A2VDH3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc38A2VDH3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc38A2VDH3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc38A2VDH3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc38A2VDH3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc38A2VDH3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc38A2VDH3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc38A2VDH3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc38A2VDH3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc38A2VDH3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc38A2VDH3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc38A2VDH3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrrc38A2VDH3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc38A2VDH3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc38A2VDH3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc38A2VDH3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc38A2VDH3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc38A2VDH3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc38A2VDH3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrc38A2VDH3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrc38A2VDH3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrc38A2VDH3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms