Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syndig1A2ANU3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syndig1A2ANU3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syndig1A2ANU3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syndig1A2ANU3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syndig1A2ANU3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syndig1A2ANU3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syndig1A2ANU3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syndig1A2ANU3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Syndig1A2ANU3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syndig1A2ANU3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syndig1A2ANU3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syndig1A2ANU3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syndig1A2ANU3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syndig1A2ANU3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syndig1A2ANU3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syndig1A2ANU3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Syndig1A2ANU3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Syndig1A2ANU3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syndig1A2ANU3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syndig1A2ANU3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syndig1A2ANU3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syndig1A2ANU3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syndig1A2ANU3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syndig1A2ANU3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syndig1A2ANU3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Syndig1A2ANU3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syndig1A2ANU3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syndig1A2ANU3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Syndig1A2ANU3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syndig1A2ANU3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syndig1A2ANU3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syndig1A2ANU3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syndig1A2ANU3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syndig1A2ANU3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syndig1A2ANU3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Syndig1A2ANU3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syndig1A2ANU3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syndig1A2ANU3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syndig1A2ANU3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syndig1A2ANU3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syndig1A2ANU3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syndig1A2ANU3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syndig1A2ANU3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syndig1A2ANU3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syndig1A2ANU3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Syndig1A2ANU3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syndig1A2ANU3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syndig1A2ANU3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syndig1A2ANU3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syndig1A2ANU3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syndig1A2ANU3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syndig1A2ANU3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syndig1A2ANU3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syndig1A2ANU3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syndig1A2ANU3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syndig1A2ANU3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syndig1A2ANU3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syndig1A2ANU3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Syndig1A2ANU3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syndig1A2ANU3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Syndig1A2ANU3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Syndig1A2ANU3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syndig1A2ANU3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syndig1A2ANU3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syndig1A2ANU3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syndig1A2ANU3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syndig1A2ANU3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syndig1A2ANU3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syndig1A2ANU3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syndig1A2ANU3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Syndig1A2ANU3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syndig1A2ANU3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syndig1A2ANU3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syndig1A2ANU3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syndig1A2ANU3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syndig1A2ANU3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syndig1A2ANU3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syndig1A2ANU3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syndig1A2ANU3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syndig1A2ANU3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syndig1A2ANU3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syndig1A2ANU3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syndig1A2ANU3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syndig1A2ANU3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syndig1A2ANU3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Syndig1A2ANU3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syndig1A2ANU3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syndig1A2ANU3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syndig1A2ANU3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syndig1A2ANU3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syndig1A2ANU3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syndig1A2ANU3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syndig1A2ANU3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syndig1A2ANU3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syndig1A2ANU3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syndig1A2ANU3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syndig1A2ANU3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syndig1A2ANU3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syndig1A2ANU3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms