Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc183A2AJB1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc183A2AJB1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc183A2AJB1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc183A2AJB1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc183A2AJB1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc183A2AJB1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc183A2AJB1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc183A2AJB1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc183A2AJB1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc183A2AJB1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc183A2AJB1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc183A2AJB1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc183A2AJB1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc183A2AJB1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc183A2AJB1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc183A2AJB1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc183A2AJB1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc183A2AJB1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc183A2AJB1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc183A2AJB1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc183A2AJB1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc183A2AJB1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc183A2AJB1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc183A2AJB1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc183A2AJB1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc183A2AJB1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc183A2AJB1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc183A2AJB1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc183A2AJB1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc183A2AJB1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc183A2AJB1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc183A2AJB1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc183A2AJB1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc183A2AJB1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc183A2AJB1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc183A2AJB1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc183A2AJB1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc183A2AJB1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc183A2AJB1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc183A2AJB1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc183A2AJB1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc183A2AJB1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc183A2AJB1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc183A2AJB1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc183A2AJB1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc183A2AJB1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc183A2AJB1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc183A2AJB1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc183A2AJB1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc183A2AJB1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ccdc183A2AJB1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc183A2AJB1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc183A2AJB1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc183A2AJB1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc183A2AJB1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc183A2AJB1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc183A2AJB1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc183A2AJB1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc183A2AJB1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc183A2AJB1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc183A2AJB1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc183A2AJB1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc183A2AJB1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc183A2AJB1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc183A2AJB1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc183A2AJB1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc183A2AJB1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc183A2AJB1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc183A2AJB1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc183A2AJB1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc183A2AJB1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc183A2AJB1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc183A2AJB1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc183A2AJB1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc183A2AJB1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc183A2AJB1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc183A2AJB1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc183A2AJB1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc183A2AJB1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc183A2AJB1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc183A2AJB1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc183A2AJB1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc183A2AJB1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc183A2AJB1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc183A2AJB1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc183A2AJB1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc183A2AJB1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc183A2AJB1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc183A2AJB1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc183A2AJB1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc183A2AJB1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc183A2AJB1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc183A2AJB1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc183A2AJB1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc183A2AJB1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc183A2AJB1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc183A2AJB1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc183A2AJB1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc183A2AJB1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms