Protein–RNA interactions for Protein: A2AIV2

Virma, Protein virilizer homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VirmaA2AIV2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VirmaA2AIV2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VirmaA2AIV2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VirmaA2AIV2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VirmaA2AIV2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VirmaA2AIV2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VirmaA2AIV2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VirmaA2AIV2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VirmaA2AIV2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VirmaA2AIV2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VirmaA2AIV2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VirmaA2AIV2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VirmaA2AIV2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VirmaA2AIV2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VirmaA2AIV2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VirmaA2AIV2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VirmaA2AIV2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VirmaA2AIV2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VirmaA2AIV2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VirmaA2AIV2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VirmaA2AIV2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VirmaA2AIV2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
VirmaA2AIV2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
VirmaA2AIV2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VirmaA2AIV2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VirmaA2AIV2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VirmaA2AIV2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VirmaA2AIV2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VirmaA2AIV2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VirmaA2AIV2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VirmaA2AIV2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VirmaA2AIV2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
VirmaA2AIV2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VirmaA2AIV2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VirmaA2AIV2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
VirmaA2AIV2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
VirmaA2AIV2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
VirmaA2AIV2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VirmaA2AIV2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VirmaA2AIV2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VirmaA2AIV2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VirmaA2AIV2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VirmaA2AIV2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VirmaA2AIV2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
VirmaA2AIV2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VirmaA2AIV2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
VirmaA2AIV2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VirmaA2AIV2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VirmaA2AIV2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
VirmaA2AIV2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VirmaA2AIV2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
VirmaA2AIV2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VirmaA2AIV2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VirmaA2AIV2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VirmaA2AIV2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
VirmaA2AIV2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VirmaA2AIV2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
VirmaA2AIV2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VirmaA2AIV2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VirmaA2AIV2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
VirmaA2AIV2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VirmaA2AIV2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
VirmaA2AIV2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VirmaA2AIV2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VirmaA2AIV2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
VirmaA2AIV2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VirmaA2AIV2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VirmaA2AIV2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VirmaA2AIV2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VirmaA2AIV2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
VirmaA2AIV2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
VirmaA2AIV2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
VirmaA2AIV2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VirmaA2AIV2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VirmaA2AIV2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
VirmaA2AIV2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
VirmaA2AIV2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
VirmaA2AIV2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VirmaA2AIV2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VirmaA2AIV2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
VirmaA2AIV2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
VirmaA2AIV2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VirmaA2AIV2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VirmaA2AIV2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VirmaA2AIV2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VirmaA2AIV2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
VirmaA2AIV2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
VirmaA2AIV2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VirmaA2AIV2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VirmaA2AIV2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VirmaA2AIV2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VirmaA2AIV2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VirmaA2AIV2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VirmaA2AIV2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VirmaA2AIV2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VirmaA2AIV2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VirmaA2AIV2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VirmaA2AIV2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VirmaA2AIV2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VirmaA2AIV2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms