Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930447F04RikA2AFR2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930447F04RikA2AFR2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930447F04RikA2AFR2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930447F04RikA2AFR2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930447F04RikA2AFR2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930447F04RikA2AFR2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930447F04RikA2AFR2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930447F04RikA2AFR2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930447F04RikA2AFR2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930447F04RikA2AFR2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930447F04RikA2AFR2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930447F04RikA2AFR2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4930447F04RikA2AFR2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
4930447F04RikA2AFR2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930447F04RikA2AFR2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16■□□□□ 0.15
4930447F04RikA2AFR2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930447F04RikA2AFR2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930447F04RikA2AFR2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
4930447F04RikA2AFR2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930447F04RikA2AFR2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
4930447F04RikA2AFR2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930447F04RikA2AFR2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930447F04RikA2AFR2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930447F04RikA2AFR2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930447F04RikA2AFR2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930447F04RikA2AFR2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930447F04RikA2AFR2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
4930447F04RikA2AFR2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930447F04RikA2AFR2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
4930447F04RikA2AFR2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930447F04RikA2AFR2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930447F04RikA2AFR2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930447F04RikA2AFR2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
4930447F04RikA2AFR2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930447F04RikA2AFR2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930447F04RikA2AFR2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930447F04RikA2AFR2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930447F04RikA2AFR2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930447F04RikA2AFR2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930447F04RikA2AFR2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930447F04RikA2AFR2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930447F04RikA2AFR2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930447F04RikA2AFR2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.2 ms